Атлас микробных сообществ России
Составляем карту мест обитания микробов, открываем неизвестные виды, ищем новые способы применения бактериям и вирусам при помощи анализа метагеномов и других биоинформатических методов.

Приглашаем волонтеров – школьников, студентов и всех остальных – присоединиться к проекту и внести свой вклад в науку!
Атлас микробных сообществ России
Составляем карту мест обитания микробов, открываем неизвестные виды, ищем новые способы применения бактериям и вирусам при помощи анализа метагеномов и других биоинформатических методов.

Приглашаем волонтеров – школьников, студентов и всех остальных – присоединиться к проекту и внести свой вклад в науку!
О проекте
Цель проекта “Атлас микробных сообществ” – исследование многообразия микроорганизмов на территории России.
Уникальность этого проекта в том, что в нем задействованы не только ученые, а широкий круг людей – школьники, студенты, волонтеры. На проекте “Атлас микробных сообществ” вы можете освоить биоинформатические методы и внести вклад в научные исследования!
Мы организуем экспедиции и собираем пробы грунта и воды в труднодоступных местах, выделяем метагеномную ДНК (ДНК всех микроорганизмов в пробах) и с помощью биоинформатических методов ищем ответы на разные увлекательные вопросы. Например, почему археи выживают в сверхгорячих источниках? Какие есть бактерии-симбионты у морских губок? Еще мы ищем новые антибиотики, вычленяя из метагеномов специальные биосинтетические кластеры.
Как это работает
Экспедиция
Сбор проб воды и грунта
Секвенирование
Анализ данных
Гражданская наука
Обучающая платформа
На нашей онлайн-платформе для обучения есть:

  • Курс лекций по биоинформатике с тестами
  • Интерактивная карта атласа с доступом к реальным данным секвенирования образцов
Из курса лекций вы узнаете:
Какими разными и необычными бывают прокариоты и их вирусы
Что такое геномные технологии: секвенирование, ПЦР, сборка геномов
Что полезного можно извлечь из геномов микроорганизмов и как это делается
Как геномы прокариот могут помочь в поиске новых лекарств
В курсе пять лекций.
Его читают сотрудники Лаборатории анализа метагеномов:
  • Константин Северинов (д.б.н, директор лаборатории)
  • Матвей Колесник (научный сотрудник)
  • Дмитрий Травин (научный сотрудник).

После каждой лекции можно проверить свои знания, выполнив тест.
Чтобы прослушать курс (он бесплатный и доступен всем), зарегистрируйтесь.
Образовательные мероприятия
Мы проводим лекции и мастер-классы для школьников и студентов, сотрудничаем со школами Москвы, Санкт-Петербурга, Нижнего Новгорода. Анонсы ближайших мероприятий можно посмотреть здесь.
Школьники на мастер-классе по биоинформатике, организованном нашей лабораторией
Проектная деятельность
Помимо обучающей платформы с курсом лекций, мы работаем со школьниками индивидуально. Они выбирают тему работы, которая соответствует одному из направлений наших исследований, и выполняют собственный проект под нашим руководством.
Проект может быть связан как с “мокрой” работой в лаборатории, так и с биоинформатическим анализом.

Примеры проектов

Поиск продуцентов антибиотиков
Работа в лаборатории с культурами бактерий. Экспериментальное определение бактерий, выделяющих антимикробные вещества
Поиск анти-рестрикционных компонентов фага T5
С помощью биоинформатических методов выясняем, как бактериофаг борется с "иммунитетом" бактерии
Анализ метавиромов морской воды
Моря очень мало исследованы с точки зрения вирусов, которые там обитают. Именно в морских пробах высок шанс найти новый неизвестный вирус
Поиск вирусов термоацидофильных архей
Эти археи живут в очень горячих кислых источниках. Есть гипотеза, что их устойчивость связана с особыми вирусами
Партнёры