Конференция молодых учёных
ГЕНОМИКА, МЕТАГЕНОМИКА
И МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ
И МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ
Программа конференции
23-24 сентября 2023 года
23 сентября, суббота
10:00 Начало регистрации участников
11:00 Открытие конференции, вступительное слово представителей Организационного комитета
11:20 Приглашенный лектор, д.б.н., проф., чл.-корр. РАН, А.В. Кульбачинский
Лекция "Белки-аргонавты и системы врожденного иммунитета у прокариот"
12:10 - Приглашенный лектор, д.б.н., к.ф.-м.н., проф. М.С. Гельфанд
Лекция "Сравнительная геномика и эволюция бактерий"
13:00 Обед
14:00 Трофимова А.Б. Арктическая экспедиция Плавучий университет 2023, НИС Дальние Зеленцы
14:20 Устные доклады участников
Иванов А.Б.
Алгоритмы извлечения признаков из метагеномных данных полногеномного секвенирования и их визуализация на графе де Брейна
Аверьянов Д.К.
Исследование in vitro свойств бактериальных белков-аргонавтов из кишечной микробиоты человека
Кравцов Д.В.
Гонококковый генетический остров в глобальной популяции Neisseria gonorrhoeae: структура, функции и ассоциация с устойчивостью к антимикробным препаратам
Дробязко А.Ю.
Защита и метилирование системы BREX I типа основано на образовании многокомпонентных комплексов и распознавании ДНК метилтрансферазой BrxX (PglX)
Попов Н.С.
Исследование вирома человека при помощи данных метагеномного секвенирования
16:00 Кофе-брейк
16:30 Начало работы постерной сессии 1
18:30 Завершение работы постерной сессии 1
11:00 Открытие конференции, вступительное слово представителей Организационного комитета
11:20 Приглашенный лектор, д.б.н., проф., чл.-корр. РАН, А.В. Кульбачинский
Лекция "Белки-аргонавты и системы врожденного иммунитета у прокариот"
12:10 - Приглашенный лектор, д.б.н., к.ф.-м.н., проф. М.С. Гельфанд
Лекция "Сравнительная геномика и эволюция бактерий"
13:00 Обед
14:00 Трофимова А.Б. Арктическая экспедиция Плавучий университет 2023, НИС Дальние Зеленцы
14:20 Устные доклады участников
Иванов А.Б.
Алгоритмы извлечения признаков из метагеномных данных полногеномного секвенирования и их визуализация на графе де Брейна
Аверьянов Д.К.
Исследование in vitro свойств бактериальных белков-аргонавтов из кишечной микробиоты человека
Кравцов Д.В.
Гонококковый генетический остров в глобальной популяции Neisseria gonorrhoeae: структура, функции и ассоциация с устойчивостью к антимикробным препаратам
Дробязко А.Ю.
Защита и метилирование системы BREX I типа основано на образовании многокомпонентных комплексов и распознавании ДНК метилтрансферазой BrxX (PglX)
Попов Н.С.
Исследование вирома человека при помощи данных метагеномного секвенирования
16:00 Кофе-брейк
16:30 Начало работы постерной сессии 1
18:30 Завершение работы постерной сессии 1
Р01 Бурмистрова Н.Р.
Риботоксин колицин Е3 индуцирует экспрессию системы спасения/репарации rtcB2-prfH в штамме E. coli ATCC25922
Р02 Головщинский А.К.
Поиск анти-рестрикционного белка бактериофага Т5
Р03 Русанова А.Н.
Предполагаемые бактериальные симбионты Porifera из Белого моря.
Р04 Андриянов А.И.
Бактериофаг BF23 избегает рестрикции и модификации ДНК в E.coli
Р05 Держаев А.А.
Абортивная нуклеаза Old фага P2 не взаимодействует с RecBCD комплексом напрямую и активируется при возникновении оцДНК шпилек
Р06 Виноградова С.В.
Исследование нуклеаз, участвующих в формировании 3’-концов преспейсеров в ходе праймированной адаптации в CRISPR-Cas системе I-E типа Escherichia coli
Р07 Кузнецова У.Д.; Магкаев А.Т
Поиск лигандов, ингибирующих белки, участвующие в формировании биопленок в Escherichia coli
Р08 Шалякина А.А.
Генетический контроль бактериальной системы секреции VI типа у штаммов Rhizobium leguminosarum bv. viciae
Р09 Кириченко А.А.
Некоторые особенности бактериальных сообществ нефтедобывающих скважин Ромашкинского месторождения
Р10 Сыромятникова Е.Д.
Потенциальное орудие колонизации растения-хозяина с точки зрения транскриптомики – гидрофобины фитопатогенных грибов Microdochium nivale
Р11 Вишневская А.И.
Высокоэффективная жидкостная хроматография совместно с масс-спектрометрией высокого разрешения и изотопный анализ как подход к изучению метаболома живых организмов
Р12 Маренина Е.А.
Сборка и сравнительный анализ штаммов гриба-возбудителя розовой снежной плесени Microdochium nivale: взгляд на внутривидовое разнообразие с точки зрения геномики
Р13 Николаева А.А.
Фитопатогенные микромицеты Fusarium oxysporum влияют на экспрессию генов синтеза и поглощения сидерофоров ризосферных бактерий
Р14 Гафарова Е.Р., Курячий Д.С.
Сравнительный анализ микробиомов сестринских видов Littorina в контексте сезонности и географии
Р15 Гладков Г.В.
Метагеномы микробных сообществ при разложении соломы овса и листового опада
Р16 Румянцева Н.А.
Способность белка SulA к димеризации и его влияние на взаимодействие FtsZ с белками-партнерами
Р17 Бибиков Н.М.
Биоразнообразие грибов-эндофитов и микоризообразователей орхидеи Goodyera repens на территории европейской части России, выявленное методом метагеномного анализа
Р18 Егоров А.А.
Сравнительный анализ геномов двух штаммов Pseudomonas aeruginosa, являющихся возбудителями заболеваний мочевыводящих путей
Р19 Сальникова Е.А.
Изучение бактериальных металлопептидаз HrrP у штаммов Rhizobium leguminosarum bv. viciae, проявляющих разную эффективность при азотфиксирующем симбиозе с горохом посевным (Pisum sativum L.)
Риботоксин колицин Е3 индуцирует экспрессию системы спасения/репарации rtcB2-prfH в штамме E. coli ATCC25922
Р02 Головщинский А.К.
Поиск анти-рестрикционного белка бактериофага Т5
Р03 Русанова А.Н.
Предполагаемые бактериальные симбионты Porifera из Белого моря.
Р04 Андриянов А.И.
Бактериофаг BF23 избегает рестрикции и модификации ДНК в E.coli
Р05 Держаев А.А.
Абортивная нуклеаза Old фага P2 не взаимодействует с RecBCD комплексом напрямую и активируется при возникновении оцДНК шпилек
Р06 Виноградова С.В.
Исследование нуклеаз, участвующих в формировании 3’-концов преспейсеров в ходе праймированной адаптации в CRISPR-Cas системе I-E типа Escherichia coli
Р07 Кузнецова У.Д.; Магкаев А.Т
Поиск лигандов, ингибирующих белки, участвующие в формировании биопленок в Escherichia coli
Р08 Шалякина А.А.
Генетический контроль бактериальной системы секреции VI типа у штаммов Rhizobium leguminosarum bv. viciae
Р09 Кириченко А.А.
Некоторые особенности бактериальных сообществ нефтедобывающих скважин Ромашкинского месторождения
Р10 Сыромятникова Е.Д.
Потенциальное орудие колонизации растения-хозяина с точки зрения транскриптомики – гидрофобины фитопатогенных грибов Microdochium nivale
Р11 Вишневская А.И.
Высокоэффективная жидкостная хроматография совместно с масс-спектрометрией высокого разрешения и изотопный анализ как подход к изучению метаболома живых организмов
Р12 Маренина Е.А.
Сборка и сравнительный анализ штаммов гриба-возбудителя розовой снежной плесени Microdochium nivale: взгляд на внутривидовое разнообразие с точки зрения геномики
Р13 Николаева А.А.
Фитопатогенные микромицеты Fusarium oxysporum влияют на экспрессию генов синтеза и поглощения сидерофоров ризосферных бактерий
Р14 Гафарова Е.Р., Курячий Д.С.
Сравнительный анализ микробиомов сестринских видов Littorina в контексте сезонности и географии
Р15 Гладков Г.В.
Метагеномы микробных сообществ при разложении соломы овса и листового опада
Р16 Румянцева Н.А.
Способность белка SulA к димеризации и его влияние на взаимодействие FtsZ с белками-партнерами
Р17 Бибиков Н.М.
Биоразнообразие грибов-эндофитов и микоризообразователей орхидеи Goodyera repens на территории европейской части России, выявленное методом метагеномного анализа
Р18 Егоров А.А.
Сравнительный анализ геномов двух штаммов Pseudomonas aeruginosa, являющихся возбудителями заболеваний мочевыводящих путей
Р19 Сальникова Е.А.
Изучение бактериальных металлопептидаз HrrP у штаммов Rhizobium leguminosarum bv. viciae, проявляющих разную эффективность при азотфиксирующем симбиозе с горохом посевным (Pisum sativum L.)
24 сентября, воскресенье
10.00 Начало работы пленарной сессии
10.10 Приглашенный лектор, к.б.н., А.Б. Исаев
Лекция "Гонка вооружений - разнообразие бактериальных систем противовирусного иммунитета"
10.45 Приглашенный лектор, к.б.н., О.С. Мушарова
Лекция "Применение CRISPR редакторов в медицине"
11.20 Кофе-брейк
11.50 Устные доклады участников
Дубовицкий Н.А.
Исследование вирома кишечника у представителей семейства Утиные (Anatidae)
Бибишева Р.Д.
Роль нового оперона Mycobacterium tuberculosis как модуля спасения и восстановления рибосом, поврежденных риботоксинами
Романенко М.Н.
Геномное разнообразие хозяйственно-ценных изолятов группы Bacillus, выделенных из различных географических регионов
Козлова С.Ю.
Исследование феномена постсегрегационного убийства клеток при CRISPR-Cas таргетировании плазмид, кодирующих системы рестрикции-модификации II типа
Савенкова Д.А.
Использование трансгенеза в создании клеточных линий для вирусологических исследований
Шенфельд А.А.
РНК транскрипт комплементарный ori-участку генома фага λ опосредует репликативное ингибирование инфекции
14.00 Обед
15.00 Начало работы постерной сессии 2
17.00 Завершение работы постерной сессии 2
17.15 Закрытие конференции
17.45 Разъезд участников
10.10 Приглашенный лектор, к.б.н., А.Б. Исаев
Лекция "Гонка вооружений - разнообразие бактериальных систем противовирусного иммунитета"
10.45 Приглашенный лектор, к.б.н., О.С. Мушарова
Лекция "Применение CRISPR редакторов в медицине"
11.20 Кофе-брейк
11.50 Устные доклады участников
Дубовицкий Н.А.
Исследование вирома кишечника у представителей семейства Утиные (Anatidae)
Бибишева Р.Д.
Роль нового оперона Mycobacterium tuberculosis как модуля спасения и восстановления рибосом, поврежденных риботоксинами
Романенко М.Н.
Геномное разнообразие хозяйственно-ценных изолятов группы Bacillus, выделенных из различных географических регионов
Козлова С.Ю.
Исследование феномена постсегрегационного убийства клеток при CRISPR-Cas таргетировании плазмид, кодирующих системы рестрикции-модификации II типа
Савенкова Д.А.
Использование трансгенеза в создании клеточных линий для вирусологических исследований
Шенфельд А.А.
РНК транскрипт комплементарный ori-участку генома фага λ опосредует репликативное ингибирование инфекции
14.00 Обед
15.00 Начало работы постерной сессии 2
17.00 Завершение работы постерной сессии 2
17.15 Закрытие конференции
17.45 Разъезд участников
Р01 Скутель М.А.
Анти-рестрикционный белок DarA бактериофага P1 ингибирует защиту BREX in trans.
Р02 Котовская О.А.
Предранний участок генома фагов семейства Autographiviridae как источник разнообразия новых антизащитных и host-takeover генов
Р03 Хвостиков Т.С.
Исследование взаимодействия ДНК-мимикрирующего белка Ocr фага T7 с нуклеоид связывающим белком HU Escherichia coli
Р04 Демкина А.О.
Сравнительный анализ методов выделения ДНК при изучении морских микробных сообществ
Р05 Яновская Д.Д.
Плазмиды, содержащие Chi-сайт, могут вызывать SOS-ответ и индуцировать аллевиацию рестрикции RecA-зависимым или независимым способом
Р06 Шпанов Д.А.
Сравнение таксономического состава прокариот малоизученного Иласского болотного массива методом метабаркодинга вариабельного V4 участка гена 16 S рРНК
Р07 Тараненко Д.В.
AcrIE9 ингибирует модельную CRISPR-Cas IE систему Escherichia coli
Р08 Белухина С.Ю.
Абортивная иммунная система PARIS активируется вирусными анти-CRISPR белками
Р09 Ярема П.О.
Абортивная система защиты IbfA (R64) относитcя к семейству Old-подобных нуклеаз
Р10 Козлова А.Д.
Молекулярное-генетическое исследование состава микробных сообществ ризопланы диких злаковых Taeniatherum caput-medusae и Dasypyrum sp. Таманского полуострова
Р11 Володина С.И.
Генетическая вариабельность вакцинных штаммов вируса миксомы (Leporipoxvirus)
Р12 Олехнович Е.И.
Выявление потенциальных механизмов вовлеченности микробиоты в ответ на иммунотерапию меланомы при помощи метагеномного анализа
Р13 Соловей Д.А.
Анализ грибковой флоры в полногеномных метагеномных данных: различные подходы и биоинформатические методы
Р14 Лебедев Е.Е.
Изменения микро”bee”ома ячеек улья в ходе индивидуального развития эмбрионов медоносной пчелы Apis mellifera
Р15 Хасанова А.А.
Определение взаимодействий между белками деления Acholeplasma laidlawii и Mycoplasma gallisepticum при помощи двугибридных систем
Р16 Кольжецов Н.П.
Секвенирование нового изолята Sporosarcina sp., выделенного из кишечного содержимого ископаемого бизона
Р17 Горошко П.В., Бараблина Ю.Е.
Результаты идентификации микроорганизмов во влагалище, методом секвенирования фрагмента гена 16s рРНК, у женщин, планирующих беременность с помощью ВРТ.
Р18 Федорова М.О.; Запорожченко Н.С.
Влияние образа жизни и возраста на метагеномы ротовой полости мышей
Р19 Гордеев А.С.
Биоразнообразие микробиома зоны почвообразования на примере лесной подстилки смешанного леса зоны южной тайги
Анти-рестрикционный белок DarA бактериофага P1 ингибирует защиту BREX in trans.
Р02 Котовская О.А.
Предранний участок генома фагов семейства Autographiviridae как источник разнообразия новых антизащитных и host-takeover генов
Р03 Хвостиков Т.С.
Исследование взаимодействия ДНК-мимикрирующего белка Ocr фага T7 с нуклеоид связывающим белком HU Escherichia coli
Р04 Демкина А.О.
Сравнительный анализ методов выделения ДНК при изучении морских микробных сообществ
Р05 Яновская Д.Д.
Плазмиды, содержащие Chi-сайт, могут вызывать SOS-ответ и индуцировать аллевиацию рестрикции RecA-зависимым или независимым способом
Р06 Шпанов Д.А.
Сравнение таксономического состава прокариот малоизученного Иласского болотного массива методом метабаркодинга вариабельного V4 участка гена 16 S рРНК
Р07 Тараненко Д.В.
AcrIE9 ингибирует модельную CRISPR-Cas IE систему Escherichia coli
Р08 Белухина С.Ю.
Абортивная иммунная система PARIS активируется вирусными анти-CRISPR белками
Р09 Ярема П.О.
Абортивная система защиты IbfA (R64) относитcя к семейству Old-подобных нуклеаз
Р10 Козлова А.Д.
Молекулярное-генетическое исследование состава микробных сообществ ризопланы диких злаковых Taeniatherum caput-medusae и Dasypyrum sp. Таманского полуострова
Р11 Володина С.И.
Генетическая вариабельность вакцинных штаммов вируса миксомы (Leporipoxvirus)
Р12 Олехнович Е.И.
Выявление потенциальных механизмов вовлеченности микробиоты в ответ на иммунотерапию меланомы при помощи метагеномного анализа
Р13 Соловей Д.А.
Анализ грибковой флоры в полногеномных метагеномных данных: различные подходы и биоинформатические методы
Р14 Лебедев Е.Е.
Изменения микро”bee”ома ячеек улья в ходе индивидуального развития эмбрионов медоносной пчелы Apis mellifera
Р15 Хасанова А.А.
Определение взаимодействий между белками деления Acholeplasma laidlawii и Mycoplasma gallisepticum при помощи двугибридных систем
Р16 Кольжецов Н.П.
Секвенирование нового изолята Sporosarcina sp., выделенного из кишечного содержимого ископаемого бизона
Р17 Горошко П.В., Бараблина Ю.Е.
Результаты идентификации микроорганизмов во влагалище, методом секвенирования фрагмента гена 16s рРНК, у женщин, планирующих беременность с помощью ВРТ.
Р18 Федорова М.О.; Запорожченко Н.С.
Влияние образа жизни и возраста на метагеномы ротовой полости мышей
Р19 Гордеев А.С.
Биоразнообразие микробиома зоны почвообразования на примере лесной подстилки смешанного леса зоны южной тайги
О конференции
Команда Лаборатории Анализа Метагеномов Сколтеха приглашает к участию в конференции «Геномика, метагеномика и молекулярная биология микроорганизмов» студентов ВУЗов старших курсов, аспирантов и молодых учёных, выполняющих исследовательские проекты по широкому кругу тем, связанных с генетикой, молекулярной биологией и биохимией микроорганизмов. Особый фокус будет сделан на работах, посвящённые анализу геномов отдельных микроорганизмов и микробных сообществ с применением методов высокопроизводительного секвенирования ДНК. Рабочий язык конференции – русский.
Конференция пройдёт 23-24 сентября 2023 года в Сколковском Институте Науки и Технологий (Москва, Территория Инновационного Центра “Сколково”, Большой бульвар д. 30, стр. 1).
Для участия необходимо заполнить форму, включающую информацию об участнике и тезисы доклада. Организационный комитет рассмотрит все поступившие заявки и пригласит участников, чьи работы будут наиболее интересны и наиболее удачно вписываются в тематику конференции. Дедлайн подачи заявок – 1 августа 2023 года (UPD: продлен до 14 августа). Участники, чьи заявки будут одобрены оргкомитетом, получат письмо-приглашение не позднее 23 августа 2023 года. Тезисы будут рекомендованы оргкомитетом для презентации в рамках устной или постерной сессии конференции.
Конференция проводится в рамках проекта «Атлас микробных сообществ Российской Федерации» (грант Министерства Образования и Науки РФ No. 075-10-2021-114 от 11 октября 2021).
Конференция пройдёт 23-24 сентября 2023 года в Сколковском Институте Науки и Технологий (Москва, Территория Инновационного Центра “Сколково”, Большой бульвар д. 30, стр. 1).
Для участия необходимо заполнить форму, включающую информацию об участнике и тезисы доклада. Организационный комитет рассмотрит все поступившие заявки и пригласит участников, чьи работы будут наиболее интересны и наиболее удачно вписываются в тематику конференции. Дедлайн подачи заявок – 1 августа 2023 года (UPD: продлен до 14 августа). Участники, чьи заявки будут одобрены оргкомитетом, получат письмо-приглашение не позднее 23 августа 2023 года. Тезисы будут рекомендованы оргкомитетом для презентации в рамках устной или постерной сессии конференции.
Конференция проводится в рамках проекта «Атлас микробных сообществ Российской Федерации» (грант Министерства Образования и Науки РФ No. 075-10-2021-114 от 11 октября 2021).
- ГдеСколковский Институт Науки и Технологий (Москва, Территория Инновационного Центра “Сколково”, Большой бульвар, д. 30, стр. 1)
- Когда23-24 сентября 2023 года
- Как участвовать
Форма регистрации и подача тезисов
Партнёры
