IV Международная конференция
IV INTERNATIONAL CONFERENCE
IV INTERNATIONAL CONFERENCE
ГЕНОМИКА, МЕТАГЕНОМИКА И МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ
GENOMICS, METAGENOMICS AND MOLECULAR BIOLOGY OF MICROORGANISMS (IV GMMMC)
GENOMICS, METAGENOMICS AND MOLECULAR BIOLOGY OF MICROORGANISMS (IV GMMMC)
Программа конференции
25-27 октября 2025 года
25 октября, суббота
09:00−10:00 Регистрация участников конференции
10:00−10:10 Открытие конференции
10:10−10:50 Лекция «Древняя ДНК и история эпидемий»
Гельфанд М.С.
д.б.н., проф., вице-президент по биомедицинским исследованиям Сколковского института науки и технологий (Сколтеха)
10:50−11:30 Лекция «Специфичность антибиотиков, ингибирующих трансляцию, по отношению к последовательности мРНК»
Сергиев П.В.
доктор химических наук, профессор, член-корреспондент РАН, и.о. директора НИИ ФХБ МГУ имени М.В. Ломоносова
11:30−12:10 Лекция «Микробиота кишечника: ключевой игрок в системном здоровье и патологии»
Беспятых Ю.А.
к.б.н., руководитель Центра молекулярной медицины и диагностики, заведующая лабораторией молекулярной медицины ФГБУ ФНКЦ ФХМ им. Ю.М. Лопухина ФМБА России. Доцент кафедры экспертизы в допинг- и наркоконтроле РХТУ ИМ. Д.И. Менделеева. Главный внештатный специалист ЦФО ФМБА по клинической микробиологии и антибиотикорезистентности
12:10−14:00 Обед
14:00−15:20 Доклады участников устной сессии
14:00−14:10 Тарасов К.А.
«Изучение микробного сообщества горячего подземного источника Баксанской нейтринной обсерватории»
14:10−14:20 Скутель M.А.
«Новая роль ORC/Cdc6/STAND АТФаз в бактериальном иммунитете»
14:20−14:30 Белоусов В.Ю.
«Распространенность и антибиотикорезистентность Klebsiella pneumoniae при внебольничных пневмониях: tNGS против классических методов»
14:30−14:40 Денисова А.А.
«Анализ разнообразия микробиома полости рта выявил отсутствие четких оротипов в метагеномных профилях»
14:40−14:50 Нохова А.Р.
«Комплексная оценка разнообразия респираторного вирома»
14:50−15:00 Брюханов А.Л.
«Метагеномика анаэробных микробных сообществ донных отложений арктических морей»
15:00−15:10 Колесник М.
«Бактериофаги Lalka - новая группа вирусов, кодирующих собственную CRISPR-Cas систему»
15:10−15:20 Ярема П.О., Хвостиков Т.C.
«Нуклеоидсвязывающий белок H-NS регулирует экспрессию защитных систем бактерий»
15:20−16:00 Лекция "Биомембраны архей и бактерий: в чем сила и слабость?"
Чугунов А.О.
к.ф.-м.н., с.н.с. группы анализа структуры мембранных белков in silico Института биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН.
16:00−16:30 Лекция от индустрии "Цифровой биобанк данных о микробиоме кишечника человека: стандартизация и новые возможности"
Кошечкин С.И.
к.б.н., Nobias Technologies, основатель, научный директор
Одинцова В.Е.
Руководитель отдела биоинформатики, Nobias Technologies
16:30−17:00 Кофе-брейк
17:00−19:00 Постерная сессия I
10:00−10:10 Открытие конференции
10:10−10:50 Лекция «Древняя ДНК и история эпидемий»
Гельфанд М.С.
д.б.н., проф., вице-президент по биомедицинским исследованиям Сколковского института науки и технологий (Сколтеха)
10:50−11:30 Лекция «Специфичность антибиотиков, ингибирующих трансляцию, по отношению к последовательности мРНК»
Сергиев П.В.
доктор химических наук, профессор, член-корреспондент РАН, и.о. директора НИИ ФХБ МГУ имени М.В. Ломоносова
11:30−12:10 Лекция «Микробиота кишечника: ключевой игрок в системном здоровье и патологии»
Беспятых Ю.А.
к.б.н., руководитель Центра молекулярной медицины и диагностики, заведующая лабораторией молекулярной медицины ФГБУ ФНКЦ ФХМ им. Ю.М. Лопухина ФМБА России. Доцент кафедры экспертизы в допинг- и наркоконтроле РХТУ ИМ. Д.И. Менделеева. Главный внештатный специалист ЦФО ФМБА по клинической микробиологии и антибиотикорезистентности
12:10−14:00 Обед
14:00−15:20 Доклады участников устной сессии
14:00−14:10 Тарасов К.А.
«Изучение микробного сообщества горячего подземного источника Баксанской нейтринной обсерватории»
14:10−14:20 Скутель M.А.
«Новая роль ORC/Cdc6/STAND АТФаз в бактериальном иммунитете»
14:20−14:30 Белоусов В.Ю.
«Распространенность и антибиотикорезистентность Klebsiella pneumoniae при внебольничных пневмониях: tNGS против классических методов»
14:30−14:40 Денисова А.А.
«Анализ разнообразия микробиома полости рта выявил отсутствие четких оротипов в метагеномных профилях»
14:40−14:50 Нохова А.Р.
«Комплексная оценка разнообразия респираторного вирома»
14:50−15:00 Брюханов А.Л.
«Метагеномика анаэробных микробных сообществ донных отложений арктических морей»
15:00−15:10 Колесник М.
«Бактериофаги Lalka - новая группа вирусов, кодирующих собственную CRISPR-Cas систему»
15:10−15:20 Ярема П.О., Хвостиков Т.C.
«Нуклеоидсвязывающий белок H-NS регулирует экспрессию защитных систем бактерий»
15:20−16:00 Лекция "Биомембраны архей и бактерий: в чем сила и слабость?"
Чугунов А.О.
к.ф.-м.н., с.н.с. группы анализа структуры мембранных белков in silico Института биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН.
16:00−16:30 Лекция от индустрии "Цифровой биобанк данных о микробиоме кишечника человека: стандартизация и новые возможности"
Кошечкин С.И.
к.б.н., Nobias Technologies, основатель, научный директор
Одинцова В.Е.
Руководитель отдела биоинформатики, Nobias Technologies
16:30−17:00 Кофе-брейк
17:00−19:00 Постерная сессия I
P01 Азнабаева З.А. «Выделение бактериофагов, лизирующих Cronobacter sakazakii»
P02 Александров M.Д. «Исследование симбиотических отношений микробных сообществ в кислотно-солевой среде»
P03 Андреевская В.М. «Изучение разнообразия микроорганизмов филлопланы на пасленовых культурах»
P04 Анисимова М.А. «Оценка метилирования генов CADM1, MAL и PAX1 методом ddPCR при ВПЧ‑ассоциированных неоплазиях шейки матки»
P05 Ахмадеева А.И. «Клонирование гена эндолизина бактериофага Pseudomonas phage Ka2 и характеристика рекомбинантного белка»
P06 Ашниев Г.А. «Гликанолитический потенциал кишечных Prevotella: in silico реконструкция метаболических путей деградации полисахаридов»
P07 Багрова Е.А. «Исследование структуры целлюлозомонооксигеназ фитопатогенного гриба Microdochium nivale с помощью молекулярного моделирования»
P08 Баскова М.В. «Использование системы SpyCatcher-SpyTag для получения аффинных сорбентов на полиметакрилатной и агарозной матрицах»
P09 Бикташева Л.Р. «Влияние физико-химических параметров на состав бактериальных сообществ нефтедобывающих скважин Ромашкинского месторождения»
P10 Газизова С.Р. «Анализ генома штамма Bacillus thuringiensis VL5, обладающего антагонистической активностью против фитопатогенных грибов»
P11 Гильмутдинова А.И. «Создание и характеристика CRISPR-редактированного штамма Bacillus subtilis с инактивированным геном dhbF, ответственного за продукцию сидерофора»
P12 Голова Д.М. «Выделение колифагов из почв города Москвы»
P13 Гордеев А.С. «Ремедиация нефтезагрязненных почв биосурфактантами, продуцируемыми штаммом Nocardiopsis sp. 3mo»
P14 Деханова Е.Н. «Генетические детерминанты полиэкстремофильности штамма Exiguobacterium chiriqhucha S12»
P15 Дюбарь А.М. «Выделение сульфатредуцирующих микроорганизмов, устойчивых к низким значениям pH и высоким концентрациям металлов»
P16 Дюбо Ю.В. «Сравнительный анализ метиломов штаммов Pectobacterium versatile»
P17 Зайцев П.А. «Функционально-метагеномный анализ альгоценозов в природных и искусственных эвтрофицированных системах»
P18 Зимина А.А. «Эволюция и разнообразие 18S рРНК Plasmodium falciparum и влияние SNP на патогенез малярии»
P19 Иванов А.Б. «Транскриптомное профилирование дофаминергических нейронов, полученных из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток, при болезни Паркинсона»
P20 Иккерт О.П. «Устойчивость почвенных штаммов Pseudomonas к глифосату: биохимические и генетические аспекты»
P21 Исламов Р.Р. «Устойчивость штаммов Pantoea brenneri к тяжелым металлам»
P22 Кобец А.В. «Исследование микроорганизмов снега и воды из Арктики»
P23 Коваленко А.В. «Влияние агротехнических приёмов на метаболические пути углеродного цикла в выщелоченном черноземе Приобья»
P24 Козлова А.Д. «Оценка влияния полиморфизмов в генах фолатного цикла (MTHFR, MTR, MTRR) на развитие РАС у детей»
P25 Колядин А.Н. «Адаптационные реакции микроорганизмов на гипомагнитные условия»
P26 Коцарев В.И. «Оценка экспрессии генов-регуляторов компетентного состояния у дикого штамма Bacillus subtilis R1»
P27 Кривоносова М.А. «Особенности микробиоты кишечника у пациентов с сахарным диабетом второго типа и влияние на нее гипербарического кислорода»
P28 Лановая О.Д. «Исследование роли интегронов в распространении генов резистентности к антибиотикам в донных отложениях Азовского моря»
P29 Мирко П.А. «Анализ геномов некультивируемых бактерий, полученных из метагеномов черноземных почв, на предмет наличия генетических маркеров олиготрофности»
P30 Плешко Е.М. «Сравнительный анализ геномов четырёх штаммов Kocuria»
P31 Полиниченко А.Е. «Антибиотикорезистентность бактерий, устойчивых к пестицидам»
P32 Полковская А.А. «Анализ микробных сообществ кожи и среды обитания амфибий и рептилий»
P33 Попов И.В. «Streptomyces albidoflavus SM254: геномные маркеры противодействия синдрому белого носа рукокрылых»
P34 Пронович Н.А. «Бактериальный ризобиом пшеницы и ее дикорастущего родственника – пырея как пул новых агентов биоконтроля»
P35 Развалиева Н.В. «Эффективность химического мутагенеза в повышении выживаемости штаммов-продуцентов Candida maltosa»
P36 Семишова Л.С. «Оценка бактериоциногенного потенциала термофильных штаммов р. Bacillus»
P37 Сергеев Г.М. «Сравнение биоинформатических программ для решения ряда актуальных задач геномной эпидемиологии Mycobacterium tuberculosis»
P38 Сидоров Д.В. «Расширение семейства зеркальных протеородопсинов и поиск сайта связывания с цинком среди микробных родопсинов»
P39 Смольянова Н.А. «Структурные особенности целлюлазы сel7465, выявленные методом малоуглового рентгеновского рассеяния, перспективы биотехнологического применения»
P40 Смутин Д.В. «Это неправильные пчелы: предсказание патогенов пчел по физическим характеристикам улья с помощью bee-ИИ»
P41 Соколов М.Н. «Распространение Quorum Quenching ферментов у прокариот»
P42 Сулейманова А.Д. «Секвенирование и анализ геномов почвенных изолятов Pantoea brenneri»
P43 Терешин М.Н. «Биокаталитический способ иммобилизации TEV-протеазы»
P44 Триска Т.И. «Изучение влияния экспрессии одиночной субъединицы SRP14 и слитного белка SRP14‑9 на секрецию рекомбинантных белков клетками CHO»
P45 Трушлис Э.В. «Индукция гормезиса наночастицами диоксида титана у пробиотических бактерий: молекулярные механизмы и потенциал для повышения синтеза бактериоцинов»
P46 Чернов Н.Ю. «Рибосомальные белки RPL7, RPL12, RPL15 как потенциальные мишени для соединений феназинового ряда»
P47 Чернышова А.С. «Разработка амплификационной панели NGS для секвенирования вируса гепатита С»
P48 Шаладонова М.И. «Гармонизация кодонов как перспективная стратегия для усиления экспрессии человеческой ароматазы в клетках E. coli»
P49 Абимбола E.T. «Предсказание видов микробов против колонизации Clostridioidesdifficile на основе путей метаболизма аминокислот: вычислительный подход»
P50 Бекиева M.Б. «Математические модели эволюции микробных геномов»
P52 Панайотов С. «Микробное биоразнообразие и модели разделения микробиоты крови у здоровых людей»
P53 Волынкина И.А. «Конъюгаты азитромицин-бензоксаборол преодолевают индуцируемую резистентность к макролидным антибиотикам»
P02 Александров M.Д. «Исследование симбиотических отношений микробных сообществ в кислотно-солевой среде»
P03 Андреевская В.М. «Изучение разнообразия микроорганизмов филлопланы на пасленовых культурах»
P04 Анисимова М.А. «Оценка метилирования генов CADM1, MAL и PAX1 методом ddPCR при ВПЧ‑ассоциированных неоплазиях шейки матки»
P05 Ахмадеева А.И. «Клонирование гена эндолизина бактериофага Pseudomonas phage Ka2 и характеристика рекомбинантного белка»
P06 Ашниев Г.А. «Гликанолитический потенциал кишечных Prevotella: in silico реконструкция метаболических путей деградации полисахаридов»
P07 Багрова Е.А. «Исследование структуры целлюлозомонооксигеназ фитопатогенного гриба Microdochium nivale с помощью молекулярного моделирования»
P08 Баскова М.В. «Использование системы SpyCatcher-SpyTag для получения аффинных сорбентов на полиметакрилатной и агарозной матрицах»
P09 Бикташева Л.Р. «Влияние физико-химических параметров на состав бактериальных сообществ нефтедобывающих скважин Ромашкинского месторождения»
P10 Газизова С.Р. «Анализ генома штамма Bacillus thuringiensis VL5, обладающего антагонистической активностью против фитопатогенных грибов»
P11 Гильмутдинова А.И. «Создание и характеристика CRISPR-редактированного штамма Bacillus subtilis с инактивированным геном dhbF, ответственного за продукцию сидерофора»
P12 Голова Д.М. «Выделение колифагов из почв города Москвы»
P13 Гордеев А.С. «Ремедиация нефтезагрязненных почв биосурфактантами, продуцируемыми штаммом Nocardiopsis sp. 3mo»
P14 Деханова Е.Н. «Генетические детерминанты полиэкстремофильности штамма Exiguobacterium chiriqhucha S12»
P15 Дюбарь А.М. «Выделение сульфатредуцирующих микроорганизмов, устойчивых к низким значениям pH и высоким концентрациям металлов»
P16 Дюбо Ю.В. «Сравнительный анализ метиломов штаммов Pectobacterium versatile»
P17 Зайцев П.А. «Функционально-метагеномный анализ альгоценозов в природных и искусственных эвтрофицированных системах»
P18 Зимина А.А. «Эволюция и разнообразие 18S рРНК Plasmodium falciparum и влияние SNP на патогенез малярии»
P19 Иванов А.Б. «Транскриптомное профилирование дофаминергических нейронов, полученных из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток, при болезни Паркинсона»
P20 Иккерт О.П. «Устойчивость почвенных штаммов Pseudomonas к глифосату: биохимические и генетические аспекты»
P21 Исламов Р.Р. «Устойчивость штаммов Pantoea brenneri к тяжелым металлам»
P22 Кобец А.В. «Исследование микроорганизмов снега и воды из Арктики»
P23 Коваленко А.В. «Влияние агротехнических приёмов на метаболические пути углеродного цикла в выщелоченном черноземе Приобья»
P24 Козлова А.Д. «Оценка влияния полиморфизмов в генах фолатного цикла (MTHFR, MTR, MTRR) на развитие РАС у детей»
P25 Колядин А.Н. «Адаптационные реакции микроорганизмов на гипомагнитные условия»
P26 Коцарев В.И. «Оценка экспрессии генов-регуляторов компетентного состояния у дикого штамма Bacillus subtilis R1»
P27 Кривоносова М.А. «Особенности микробиоты кишечника у пациентов с сахарным диабетом второго типа и влияние на нее гипербарического кислорода»
P28 Лановая О.Д. «Исследование роли интегронов в распространении генов резистентности к антибиотикам в донных отложениях Азовского моря»
P29 Мирко П.А. «Анализ геномов некультивируемых бактерий, полученных из метагеномов черноземных почв, на предмет наличия генетических маркеров олиготрофности»
P30 Плешко Е.М. «Сравнительный анализ геномов четырёх штаммов Kocuria»
P31 Полиниченко А.Е. «Антибиотикорезистентность бактерий, устойчивых к пестицидам»
P32 Полковская А.А. «Анализ микробных сообществ кожи и среды обитания амфибий и рептилий»
P33 Попов И.В. «Streptomyces albidoflavus SM254: геномные маркеры противодействия синдрому белого носа рукокрылых»
P34 Пронович Н.А. «Бактериальный ризобиом пшеницы и ее дикорастущего родственника – пырея как пул новых агентов биоконтроля»
P35 Развалиева Н.В. «Эффективность химического мутагенеза в повышении выживаемости штаммов-продуцентов Candida maltosa»
P36 Семишова Л.С. «Оценка бактериоциногенного потенциала термофильных штаммов р. Bacillus»
P37 Сергеев Г.М. «Сравнение биоинформатических программ для решения ряда актуальных задач геномной эпидемиологии Mycobacterium tuberculosis»
P38 Сидоров Д.В. «Расширение семейства зеркальных протеородопсинов и поиск сайта связывания с цинком среди микробных родопсинов»
P39 Смольянова Н.А. «Структурные особенности целлюлазы сel7465, выявленные методом малоуглового рентгеновского рассеяния, перспективы биотехнологического применения»
P40 Смутин Д.В. «Это неправильные пчелы: предсказание патогенов пчел по физическим характеристикам улья с помощью bee-ИИ»
P41 Соколов М.Н. «Распространение Quorum Quenching ферментов у прокариот»
P42 Сулейманова А.Д. «Секвенирование и анализ геномов почвенных изолятов Pantoea brenneri»
P43 Терешин М.Н. «Биокаталитический способ иммобилизации TEV-протеазы»
P44 Триска Т.И. «Изучение влияния экспрессии одиночной субъединицы SRP14 и слитного белка SRP14‑9 на секрецию рекомбинантных белков клетками CHO»
P45 Трушлис Э.В. «Индукция гормезиса наночастицами диоксида титана у пробиотических бактерий: молекулярные механизмы и потенциал для повышения синтеза бактериоцинов»
P46 Чернов Н.Ю. «Рибосомальные белки RPL7, RPL12, RPL15 как потенциальные мишени для соединений феназинового ряда»
P47 Чернышова А.С. «Разработка амплификационной панели NGS для секвенирования вируса гепатита С»
P48 Шаладонова М.И. «Гармонизация кодонов как перспективная стратегия для усиления экспрессии человеческой ароматазы в клетках E. coli»
P49 Абимбола E.T. «Предсказание видов микробов против колонизации Clostridioidesdifficile на основе путей метаболизма аминокислот: вычислительный подход»
P50 Бекиева M.Б. «Математические модели эволюции микробных геномов»
P52 Панайотов С. «Микробное биоразнообразие и модели разделения микробиоты крови у здоровых людей»
P53 Волынкина И.А. «Конъюгаты азитромицин-бензоксаборол преодолевают индуцируемую резистентность к макролидным антибиотикам»
26 октября, воскресенье
09:00−09:10 Вступительное слово
09:10−09:50 Лекция "Стратегии защиты и контрзащиты в гонке вооружений между фагом и бактерией"
Питер Финеран
Профессор, Университет Отаго, Новая Зеландия
09:50−10:30 Лекция "Национальная генетическая инициатива"
Мушарова О. С.
к.б.н., Начальник биомедицинского отдела ООО "Биотек кампус"
10:30−11:00 Кофе-брейк
11:00−12:20 Доклады участников устной сессии
11:00−11:10 Держаев А.А.
«Tin: минимальная абортивная PD-(D/E)XK нуклеаза, сочетающая функции сенсора и эффектора для защиты от бактериофагов»
11:10−11:20 Николайчик Е.А.
«Актуальные возможности и перспективы полногеномного анализа сигналов контроля транскрипции бактерий»
11:20−11:30 Бескровная М.А.
«Анализ активности прокариотических белков-аргонавтов, ассоциированных с SMEK-нуклеазой»
11:30−11:40 Ливенский А.Д.
«Оценка уровней всех аа-тРНК in vivo и in vitro при помощи ВЭЖХ-МС»
11:40−11:50 Скворцова Ю.В.
«Воздействие антисмысловыми олигонуклеотидами на малую РНК Mycobacterium tuberculosis модулирует иммунный ответ при инфекции»
11:50−12:00 Болатчиев А.Д.
«Майнинг пептидных антибиотиков из протеома Blautia producta (компонент микробиома человека)»
12:00−12:10 Андриянов А.И.
«SAM-лиаза бактериофага T3: тройной удар по системам рестрикции-модификации»
12:10−12:20 Федорова М.С.
«Бактериофаги Pseudomonas для антимикробной терапии синегнойных инфекций»
12:20−13:00 Лекция «Бактериальные фитопатогены: разнообразие, диагностика и перспективы применения бактериофагов для биоконтроля»
Мирошников К.А.
д.х.н., член-корреспондент РАН, заведующий лабораторией молекулярной биоинженерии Института биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН
13:00−14:00 Обед
14:00−14:30 Лекция «Распространенность и генетическое разнообразие коронавирусов у млекопитающих в России: мост между Европой и Азией»
Сперанская А.С.
к.б.н., ВРИО зав.лаб. "ДНК-метилом и редактирование транскриптома" ИОГен РАН.
14:30−16:30 Постерная сессия II
16:30−17:00 Церемония закрытия конференции
09:10−09:50 Лекция "Стратегии защиты и контрзащиты в гонке вооружений между фагом и бактерией"
Питер Финеран
Профессор, Университет Отаго, Новая Зеландия
09:50−10:30 Лекция "Национальная генетическая инициатива"
Мушарова О. С.
к.б.н., Начальник биомедицинского отдела ООО "Биотек кампус"
10:30−11:00 Кофе-брейк
11:00−12:20 Доклады участников устной сессии
11:00−11:10 Держаев А.А.
«Tin: минимальная абортивная PD-(D/E)XK нуклеаза, сочетающая функции сенсора и эффектора для защиты от бактериофагов»
11:10−11:20 Николайчик Е.А.
«Актуальные возможности и перспективы полногеномного анализа сигналов контроля транскрипции бактерий»
11:20−11:30 Бескровная М.А.
«Анализ активности прокариотических белков-аргонавтов, ассоциированных с SMEK-нуклеазой»
11:30−11:40 Ливенский А.Д.
«Оценка уровней всех аа-тРНК in vivo и in vitro при помощи ВЭЖХ-МС»
11:40−11:50 Скворцова Ю.В.
«Воздействие антисмысловыми олигонуклеотидами на малую РНК Mycobacterium tuberculosis модулирует иммунный ответ при инфекции»
11:50−12:00 Болатчиев А.Д.
«Майнинг пептидных антибиотиков из протеома Blautia producta (компонент микробиома человека)»
12:00−12:10 Андриянов А.И.
«SAM-лиаза бактериофага T3: тройной удар по системам рестрикции-модификации»
12:10−12:20 Федорова М.С.
«Бактериофаги Pseudomonas для антимикробной терапии синегнойных инфекций»
12:20−13:00 Лекция «Бактериальные фитопатогены: разнообразие, диагностика и перспективы применения бактериофагов для биоконтроля»
Мирошников К.А.
д.х.н., член-корреспондент РАН, заведующий лабораторией молекулярной биоинженерии Института биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН
13:00−14:00 Обед
14:00−14:30 Лекция «Распространенность и генетическое разнообразие коронавирусов у млекопитающих в России: мост между Европой и Азией»
Сперанская А.С.
к.б.н., ВРИО зав.лаб. "ДНК-метилом и редактирование транскриптома" ИОГен РАН.
14:30−16:30 Постерная сессия II
16:30−17:00 Церемония закрытия конференции
P01 Александрова М.В. «Роль тРНК фага в уклонении от бактериальной системы PARIS»
P02 Алиева М.К. «Изучение активности Cas4-подобной нуклеазы в комплексе с прокариотическим белком-аргонавтом»
P03 Аникин А.А. «Разработка автоматизированного алгоритма анализа данных высокоразрешающего анализа кривых плавления вариабельных участков 16S рРНК гена для профилирования композиции микробиома»
P04 Антакова Ю.А. «Зачем Xanthomonas campestris pv. campestris TAL-эффекторы?»
P05 Арслан Л.А. «Изучение микробиоты кишечника среди пациентов с раком молочной железы в ремиссии после курса химиотерапии»
P06 Архипова А.Л. «Молекулярно-генетический анализ гибридных плазмид клинических изолятов Klebsiella pneumoniae»
P07 Балаж И.А. «Оптимизация методики цитометрической дактилоскопии микробиоты и ее применение для мониторинга состояния in vitro модели микробиоты кишечника»
P08 Белоусов М.А. «Белок, имитирующий вирусную ДНК, инактивирует нуклеоидсвязывающий белок HU»
P09 Белухина С.Ю. «Специфичность и механизм расщепления тРНК доменом TOPRIM эффектора AriB иммунной системы PARIS»
P10 Быченко О.С. «Иммуномодулирующая роль внеклеточных везикул макрофагов, инфицированных Mycobacterium abscessus»
P11 Голофеева Д.М. «Новые белки иммунитета, кодируемые комменсальной кишечной палочкой человека Escherichia coli HS»
P12 Бондарева К.С. «Анализ генома мутантного штамма B-162/2 Pseudomonas chlororaphis subsp. aurantiaca и идентификация мутаций обеспечивающих сверхпродукцию и устойчивость к собственным феназинам»
P13 Данилова О.А. «Микроэволюционные процессы в геномах резидентных штаммов микробиоты кишечника человека: анализ однонуклеотидных полиморфизмов»
P14 Демкина А.О. «Детекция разрывов геномной ДНК in situ, генерируемых нуклеазами рестрикции»
P15 Держаев А.А. «RecBCD и антифаговый иммунитет – обманчивая история OLD белка»
P16 Дмитриев А.А. «42 ген из бактериофага phiFa оказался эндотоксином для E. coli»
P17 Дорож О. «Fun/Z абортивная иммунная система, связанная с компонентом репликации архей и эукариот»
P18 Дробязко А.Ю. «Защита и метилирование BREX требуют создания многокомпонентных комплексов»
P19 Ильина Е.Г. «Оптимизация условий культивирования и протоколов выделения ДНК из коммерческих пробиотических штаммов»
P20 Карташова А.В. «Получение панели нокаут-мутантов Pseudomonasaeruginosa методами обратной генетики для исследования роли белков внеклеточного матрикса в формировании биопленок»
P21 Козлова С.Ю. «Взаимодействие между системами рестрикции-модификации и ферментом RecBCD в защите фага»
P22 Козлова А.Д. «Зависимые от диеты вариации микробиомов кишечника канадских медоносных пчел (Apismellifera)»
P23 Колотова В. «Вирусные киназы: от захвата контроля над клеткой-хозяином до модуляции бактериального иммунитета»
P24 Комякова А.М. «Выбор сигнальных пептидов для обеспечения направленной секреции рекомбинантных белков в Escherichia coli»
P25 Котовская О.А. «Исследование разнообразия генов захвата контроля над хозяином и уклонения от иммунитета в специфических горячих точках геномов бактериофагов»
P26 Мирошникова К.А. «Бактериальный микробиом криотурбированных почв Арктики»
P27 Нечаева Ю.И. «Анализ генома галотолерантного штамма Rhodococcus sp. 5A-K4 – активного деструктора фталатов»
P28 Никифорова Е.М. «Независимое от PAM обнаружение Cas12a специфических LAMP продуктов с помощью таргетирования ампликонных петель»
P29 Онасенко К.А. «Способность к утилизации органосульфонатов бактериями родов Bacillus и Paenibacillus в условиях моноуглеродного питания и их генетический потенциал»
P30 Панайотов С. «Профилирование фунгиома у пациентов с лёгочным саркоидозом с использованием таргетного секвенирования биоптатов, бронхоальвеолярного лаважа (БАЛ) и образцов крови»
P31 Панайотов С. «Анализ бактериального сообщества пещеры Веревкина»
P32 Пахомова М.Д. «Идентификация гена Ogataea polymorpha, кодирующего α-1,2-маннозилтрансферазу, которая влияет на устойчивость к ортованадату и процесс укладки секретируемых белков»
P33 Пашинцева А.В. «Профаг λ кодирует иммунную систему Septu, которая активируется SSB белком фага T4»
P34 Пуликова Е.П. «Адаптационный потенциал нитрификаторов к длительному загрязнению почвы цинком»
P35 Путилов И.А. «Бактериофаг Тео - новый вид для биоконтроля фитопатогенных Rhizobium spp.»
P36 Пыркин В.О. «Метаболический потенциал микробных сообществ Баренцева и Печорского морей к биодеградации углеводородов»
P37 Розанцева В.В. «Использование флуоресцентных белков-репортёров для изучения метаболизма Corynebacterium glutamicum»
P38 Сапожникова А.П. «Характеристики комплекса SMC Ureaplasma parvum»
P39 Скутель М. «Иммунитет системы BREX зависит от передачи сигнала через ORC/STAND домен белка BrxC и нуклеазной активности эффектора BrxZ»
P40 Смирнов А. «BREX типа IV является системой антифагового иммунитета на основе фосфоротиоации»
P41 Смутин Д.В. «Они делают неправильный мед: патологическая метагеномика пчелиного улья»
P42 Сокольникова Л.В. «Получение штамма Pantoea brenneri 3.2 с делетированным геном индол-3-пируватдекарбоксилазы (ipdC) и изучение его свойств»
P43 Тараненко Д.В. «AcrIE9 является мощным ингибитором системы CRISPR-Cas типа I-E Escherichia coli»
P44 Таратынова М.О. «Биоконверсия метана в высокоценный каротиноид кантаксантин с использованием Methylococcus capsulatus и генетически модифицированной Yarrowia lipolytica»
P45 Трошина Д.А. «Геномное разнообразие Limosilactobacillus fermentum»
P46 Уварова М.А. «Роль противоиммунных белков в подавлении иммунной системы в их нативном контексте»
P47 Удовиченко В.Д. «Конструирование цельноклеточных lux-биосенсоров Bacillus subtilis, индуцируемых повреждением мембран»
P48 Хабибуллин Т.А. «Исследование катаболизма маннитола в дрожжах Yarrowialipolytica»
P49 Хвостиков Т.С. «Ретрон Eco1 контролируется нуклеоид-связывающим белком H-NS»
P50 Царькова Ю.Р. «Геномный потенциал штамма Achromobacter sp. DK10 в деструкции устойчивых органических соединений»
P51 Шенфельд А.А. «Антисмысловая РНК аО ориджина репликации, контролирует инфекцию бактериофагом лямбда»
P52 Шипунова А.Е. «Исследование паттернов AID/APOBEC-зависимого мутагенеза в геноме дрожжей Saccharomyces cerevisiae с делецией генов HST3 и HST4»
P53 Шокодько И.А. «Эволюционный анализ бактериальных гомологов семейства белков сиртуинов»
P54 Яновская Д.Д. «Двойная активность защитных белков ArdB и AcrIC11 в отношении систем рестрикции-модификации и CRISPR-Cas»
P02 Алиева М.К. «Изучение активности Cas4-подобной нуклеазы в комплексе с прокариотическим белком-аргонавтом»
P03 Аникин А.А. «Разработка автоматизированного алгоритма анализа данных высокоразрешающего анализа кривых плавления вариабельных участков 16S рРНК гена для профилирования композиции микробиома»
P04 Антакова Ю.А. «Зачем Xanthomonas campestris pv. campestris TAL-эффекторы?»
P05 Арслан Л.А. «Изучение микробиоты кишечника среди пациентов с раком молочной железы в ремиссии после курса химиотерапии»
P06 Архипова А.Л. «Молекулярно-генетический анализ гибридных плазмид клинических изолятов Klebsiella pneumoniae»
P07 Балаж И.А. «Оптимизация методики цитометрической дактилоскопии микробиоты и ее применение для мониторинга состояния in vitro модели микробиоты кишечника»
P08 Белоусов М.А. «Белок, имитирующий вирусную ДНК, инактивирует нуклеоидсвязывающий белок HU»
P09 Белухина С.Ю. «Специфичность и механизм расщепления тРНК доменом TOPRIM эффектора AriB иммунной системы PARIS»
P10 Быченко О.С. «Иммуномодулирующая роль внеклеточных везикул макрофагов, инфицированных Mycobacterium abscessus»
P11 Голофеева Д.М. «Новые белки иммунитета, кодируемые комменсальной кишечной палочкой человека Escherichia coli HS»
P12 Бондарева К.С. «Анализ генома мутантного штамма B-162/2 Pseudomonas chlororaphis subsp. aurantiaca и идентификация мутаций обеспечивающих сверхпродукцию и устойчивость к собственным феназинам»
P13 Данилова О.А. «Микроэволюционные процессы в геномах резидентных штаммов микробиоты кишечника человека: анализ однонуклеотидных полиморфизмов»
P14 Демкина А.О. «Детекция разрывов геномной ДНК in situ, генерируемых нуклеазами рестрикции»
P15 Держаев А.А. «RecBCD и антифаговый иммунитет – обманчивая история OLD белка»
P16 Дмитриев А.А. «42 ген из бактериофага phiFa оказался эндотоксином для E. coli»
P17 Дорож О. «Fun/Z абортивная иммунная система, связанная с компонентом репликации архей и эукариот»
P18 Дробязко А.Ю. «Защита и метилирование BREX требуют создания многокомпонентных комплексов»
P19 Ильина Е.Г. «Оптимизация условий культивирования и протоколов выделения ДНК из коммерческих пробиотических штаммов»
P20 Карташова А.В. «Получение панели нокаут-мутантов Pseudomonasaeruginosa методами обратной генетики для исследования роли белков внеклеточного матрикса в формировании биопленок»
P21 Козлова С.Ю. «Взаимодействие между системами рестрикции-модификации и ферментом RecBCD в защите фага»
P22 Козлова А.Д. «Зависимые от диеты вариации микробиомов кишечника канадских медоносных пчел (Apismellifera)»
P23 Колотова В. «Вирусные киназы: от захвата контроля над клеткой-хозяином до модуляции бактериального иммунитета»
P24 Комякова А.М. «Выбор сигнальных пептидов для обеспечения направленной секреции рекомбинантных белков в Escherichia coli»
P25 Котовская О.А. «Исследование разнообразия генов захвата контроля над хозяином и уклонения от иммунитета в специфических горячих точках геномов бактериофагов»
P26 Мирошникова К.А. «Бактериальный микробиом криотурбированных почв Арктики»
P27 Нечаева Ю.И. «Анализ генома галотолерантного штамма Rhodococcus sp. 5A-K4 – активного деструктора фталатов»
P28 Никифорова Е.М. «Независимое от PAM обнаружение Cas12a специфических LAMP продуктов с помощью таргетирования ампликонных петель»
P29 Онасенко К.А. «Способность к утилизации органосульфонатов бактериями родов Bacillus и Paenibacillus в условиях моноуглеродного питания и их генетический потенциал»
P30 Панайотов С. «Профилирование фунгиома у пациентов с лёгочным саркоидозом с использованием таргетного секвенирования биоптатов, бронхоальвеолярного лаважа (БАЛ) и образцов крови»
P31 Панайотов С. «Анализ бактериального сообщества пещеры Веревкина»
P32 Пахомова М.Д. «Идентификация гена Ogataea polymorpha, кодирующего α-1,2-маннозилтрансферазу, которая влияет на устойчивость к ортованадату и процесс укладки секретируемых белков»
P33 Пашинцева А.В. «Профаг λ кодирует иммунную систему Septu, которая активируется SSB белком фага T4»
P34 Пуликова Е.П. «Адаптационный потенциал нитрификаторов к длительному загрязнению почвы цинком»
P35 Путилов И.А. «Бактериофаг Тео - новый вид для биоконтроля фитопатогенных Rhizobium spp.»
P36 Пыркин В.О. «Метаболический потенциал микробных сообществ Баренцева и Печорского морей к биодеградации углеводородов»
P37 Розанцева В.В. «Использование флуоресцентных белков-репортёров для изучения метаболизма Corynebacterium glutamicum»
P38 Сапожникова А.П. «Характеристики комплекса SMC Ureaplasma parvum»
P39 Скутель М. «Иммунитет системы BREX зависит от передачи сигнала через ORC/STAND домен белка BrxC и нуклеазной активности эффектора BrxZ»
P40 Смирнов А. «BREX типа IV является системой антифагового иммунитета на основе фосфоротиоации»
P41 Смутин Д.В. «Они делают неправильный мед: патологическая метагеномика пчелиного улья»
P42 Сокольникова Л.В. «Получение штамма Pantoea brenneri 3.2 с делетированным геном индол-3-пируватдекарбоксилазы (ipdC) и изучение его свойств»
P43 Тараненко Д.В. «AcrIE9 является мощным ингибитором системы CRISPR-Cas типа I-E Escherichia coli»
P44 Таратынова М.О. «Биоконверсия метана в высокоценный каротиноид кантаксантин с использованием Methylococcus capsulatus и генетически модифицированной Yarrowia lipolytica»
P45 Трошина Д.А. «Геномное разнообразие Limosilactobacillus fermentum»
P46 Уварова М.А. «Роль противоиммунных белков в подавлении иммунной системы в их нативном контексте»
P47 Удовиченко В.Д. «Конструирование цельноклеточных lux-биосенсоров Bacillus subtilis, индуцируемых повреждением мембран»
P48 Хабибуллин Т.А. «Исследование катаболизма маннитола в дрожжах Yarrowialipolytica»
P49 Хвостиков Т.С. «Ретрон Eco1 контролируется нуклеоид-связывающим белком H-NS»
P50 Царькова Ю.Р. «Геномный потенциал штамма Achromobacter sp. DK10 в деструкции устойчивых органических соединений»
P51 Шенфельд А.А. «Антисмысловая РНК аО ориджина репликации, контролирует инфекцию бактериофагом лямбда»
P52 Шипунова А.Е. «Исследование паттернов AID/APOBEC-зависимого мутагенеза в геноме дрожжей Saccharomyces cerevisiae с делецией генов HST3 и HST4»
P53 Шокодько И.А. «Эволюционный анализ бактериальных гомологов семейства белков сиртуинов»
P54 Яновская Д.Д. «Двойная активность защитных белков ArdB и AcrIC11 в отношении систем рестрикции-модификации и CRISPR-Cas»
P55 Adelere B. «Защитная система Wadjet таргетирует как плазмид, так и бактериофагов»
'P51 Ли С. «Белок Rpl36 как потенциальная новая мишень для соединений феназинового ряда в эукариотических клетках»
27 октября, понедельник
Закрытый круглый стол с представителями индустрии
Conference program
October 25-27, 2025
October 25, Saturday
09:00−10:00 Conference Registration
10:00−10:10 Conference Opening
10:10−10:50 Lecture "Ancient DNA and the History of Epidemics"
M.S.Gelfand
D.Sc. in Biology, Professor, Vice President for Biomedical Research, Skolkovo Institute of Science and Technology (Skoltech)
10:50−11:30 Lecture "Specificity of Translation-Inhibiting Antibiotics towards mRNA Sequence"
P.V.Sergiev
D.Sc. in Chemistry, Professor, Corresponding Member of the Russian Academy of Sciences (RAS), Acting Director of the Institute of Functional Genomics and Biochemistry, Lomonosov Moscow State University
11:30−12:10 Lecture "Gut Microbiota: A Key Player in Systemic Health and Pathology"
Yu.A.Bespyatykh
Ph.D. in Biology, Head of the Center for Molecular Medicine and Diagnostics, Head of the Laboratory of Molecular Medicine, Yu.M. Lopukhin Federal Research and Clinical Center for Physical and Chemical Medicine of FMBA of Russia. Associate Professor, Department of Expertise in Doping and Narcotics Control, Mendeleev University of Chemical Technology. Chief External Specialist of the Central Federal District, FMBA of Russia, in Clinical Microbiology and Antibiotic Resistance
12:10−14:00 Lunch
14:00−15:20 Oral Session Presentations
14:00−14:10 K.A. Tarasov
"Study of the Microbial Community of the Baksan Neutrino Observatory Hot Spring"
14:10−14:20 M.A. Skutel
"A new role for ORC/Cdc6/STAND ATPases in bacterial immunity"
14:20−14:30 V.Yu. Belousov
"Prevalence and Antibiotic Resistance of Klebsiella pneumoniae in Community-Acquired Pneumonias: tNGS vs. Classical Methods"
14:30−14:40 A.A. Denisova
"Analysis of Oral Microbiome Diversity Reveals the Absence of Clear Orotypes in Metagenomic Profiles"
14:40−14:50 A.R. Nokhova
"Comprehensive Assessment of Respiratory Vironne Diversity"
14:50−15:00 A.L. Bryukhanov
"Metagenomics of Anaerobic Microbial Communities in Arctic Sea Bottom Sediments"
15:00−15:10 M. Kolesnik
"Lalka bacteriophages are a new group of viruses encoding their own CRISPR-Cas system."
15:10−15:20 P.O. Iarema, T.S. Khvostikov
"Nucleoid-Binding Protein H-NS Regulates Expression of Bacterial Defense Systems"
15:20−16:00 Lecture "Archaeal and Bacterial Biomembranes: What are their Strengths and Weaknesses?"
A.O. Chugunov
Ph.D. in Physics and Mathematics, Senior Research Scientist, In silico Membrane Protein Structure Analysis Group, M.M. Shemyakin and Yu.A. Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry, RAS
16:00−16:30 Industry Lecture "Digital Biobank of Human Gut Microbiome Data: Standardization and New Opportunities"
S.I. Koshechkin
Ph.D. in Biology, Nobias Technologies, Founder, CSO
V.E. Odintsova
Head of Bioinformatics Department, Nobias Technologies
16:30-17:00 Coffee Break
17:00-19:00 Poster Session I
10:00−10:10 Conference Opening
10:10−10:50 Lecture "Ancient DNA and the History of Epidemics"
M.S.Gelfand
D.Sc. in Biology, Professor, Vice President for Biomedical Research, Skolkovo Institute of Science and Technology (Skoltech)
10:50−11:30 Lecture "Specificity of Translation-Inhibiting Antibiotics towards mRNA Sequence"
P.V.Sergiev
D.Sc. in Chemistry, Professor, Corresponding Member of the Russian Academy of Sciences (RAS), Acting Director of the Institute of Functional Genomics and Biochemistry, Lomonosov Moscow State University
11:30−12:10 Lecture "Gut Microbiota: A Key Player in Systemic Health and Pathology"
Yu.A.Bespyatykh
Ph.D. in Biology, Head of the Center for Molecular Medicine and Diagnostics, Head of the Laboratory of Molecular Medicine, Yu.M. Lopukhin Federal Research and Clinical Center for Physical and Chemical Medicine of FMBA of Russia. Associate Professor, Department of Expertise in Doping and Narcotics Control, Mendeleev University of Chemical Technology. Chief External Specialist of the Central Federal District, FMBA of Russia, in Clinical Microbiology and Antibiotic Resistance
12:10−14:00 Lunch
14:00−15:20 Oral Session Presentations
14:00−14:10 K.A. Tarasov
"Study of the Microbial Community of the Baksan Neutrino Observatory Hot Spring"
14:10−14:20 M.A. Skutel
"A new role for ORC/Cdc6/STAND ATPases in bacterial immunity"
14:20−14:30 V.Yu. Belousov
"Prevalence and Antibiotic Resistance of Klebsiella pneumoniae in Community-Acquired Pneumonias: tNGS vs. Classical Methods"
14:30−14:40 A.A. Denisova
"Analysis of Oral Microbiome Diversity Reveals the Absence of Clear Orotypes in Metagenomic Profiles"
14:40−14:50 A.R. Nokhova
"Comprehensive Assessment of Respiratory Vironne Diversity"
14:50−15:00 A.L. Bryukhanov
"Metagenomics of Anaerobic Microbial Communities in Arctic Sea Bottom Sediments"
15:00−15:10 M. Kolesnik
"Lalka bacteriophages are a new group of viruses encoding their own CRISPR-Cas system."
15:10−15:20 P.O. Iarema, T.S. Khvostikov
"Nucleoid-Binding Protein H-NS Regulates Expression of Bacterial Defense Systems"
15:20−16:00 Lecture "Archaeal and Bacterial Biomembranes: What are their Strengths and Weaknesses?"
A.O. Chugunov
Ph.D. in Physics and Mathematics, Senior Research Scientist, In silico Membrane Protein Structure Analysis Group, M.M. Shemyakin and Yu.A. Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry, RAS
16:00−16:30 Industry Lecture "Digital Biobank of Human Gut Microbiome Data: Standardization and New Opportunities"
S.I. Koshechkin
Ph.D. in Biology, Nobias Technologies, Founder, CSO
V.E. Odintsova
Head of Bioinformatics Department, Nobias Technologies
16:30-17:00 Coffee Break
17:00-19:00 Poster Session I
P01 Z.A. Aznabayeva "Isolation of Bacteriophages Lysing Cronobacter sakazakii"
P02 M.D. Aleksandrov "Investigation of Symbiotic Relationships in Microbial Communities in Acidic-Saline Environments"
P03 V.M. Andreevskaya "Study of Phylloplane Microorganism Diversity on Solanaceous Crops"
P04 M.A. Anisimova "Assessment of CADM1, MAL, and PAX1 Gene Methylation by ddPCR in HPV-Associated Cervical Neoplasias"
P05 A.I. Akhmadeeva "Cloning of the Endolysin Gene of Pseudomonas Phage Ka2 and Characterization of the Recombinant Protein"
P06 G.A. Ashniyev "The Glycanolytic Potential of Intestinal Prevotella: In Silico Reconstruction of Polysaccharide Degradation Pathways"
P07 E.A. Bagrova "Investigation of the Structure of Cellulosomemonoxygenases from the Phytopathogenic Fungus Microdochium nivale Using Molecular Modeling"
P08 M.V. Baskova "Use of the SpyCatcher-SpyTag System for Obtaining Affinity Sorbents on Polymethacrylate and Agarose Matrices"
P09 L.R. Biktasheva "Influence of Physicochemical Parameters on the Composition of Bacterial Communities in Oil-Producing Wells of the Romashkinskoye Field"
P10 S.R. Gazizova "Genome Analysis of the Bacillus thuringiensis VL5 Strain with Antagonistic Activity Against Phytopathogenic Fungi"
P11 A.I. Gilmutdinova "Creation and Characterization of a CRISPR-Edited Bacillus subtilis Strain with an Inactivated dhbF Gene Responsible for Siderophore Production"
P12 D.M. Golova "Isolation of Coliphages from Moscow City Soils"
P13 A.S. Gordeev "Remediation of Oil-Contaminated Soils with Biosurfactants Produced by the Strain Nocardiopsis sp. 3mo"
P14 E.N. Dekhanova "Genetic Determinants of Polyextremophily in the Exiguobacterium chiriqhucha S12 Strain"
P15 A.M. Dyubar "Isolation of Sulfate-Reducing Microorganisms Resistant to Low pH and High Metal Concentrations"
P16 Yu.V. Dyubo "Comparative Analysis of Methylomes of Pectobacterium versatile Strains"
P17 P.A. Zaitsev "Functional-Metagenomic Analysis of Algocenoses in Natural and Artificial Eutrophicated Systems"
P18 A.A. Zimina "Evolution and Diversity of 18S rRNA in Plasmodium falciparum and the Impact of SNPs on Malaria Pathogenesis"
P19 A.B. Ivanov "Transcriptomic Profiling of Dopaminergic Neurons Derived from Induced Pluripotent Stem Cells in Parkinson's Disease"
P20 O.P. Ikkert "Soil Pseudomonas Strain Resistance to Glyphosate: Biochemical and Genetic Aspects"
P21 R.R. Islamov "Heavy Metal Resistance in Pantoea brenneri Strains"
P22 A.V. Kobets "Study of Microorganisms from Arctic Snow and Water"
P23 A.V. Kovalenko "Influence of Agricultural Practices on Carbon Cycle Metabolic Pathways in Leached Chernozem of the Ob Region"
P24 A.D. Kozlova "Assessment of the Influence of Folate Cycle Gene Polymorphisms (MTHFR, MTR, MTRR) on the Development of ASD in Children"
P25 A.N. Kolyadin "Adaptive Responses of Microorganisms to Hypomagnetic Conditions"
P26 V.I. Kotsarev "Assessment of Competence State Regulator Gene Expression in the Wild-Type Bacillus subtilis R1 Strain"
P27 M.A. Krivonosova "Features of Gut Microbiota in Patients with Type 2 Diabetes Mellitus and the Impact of Hyperbaric Oxygen on It"
P28 O.D. Lanovaya "Investigation of the Role of Integrons in the Spread of Antibiotic Resistance Genes in Azov Sea Bottom Sediments"
P29 P.A. Mirko "Analysis of Genomes of Uncultivated Bacteria from Chernozem Soil Metagenomes for Genetic Markers of Oligotrophy"
P30 E.M. Pleshko "Comparative Genomic Analysis of Four Kocuria Strains"
P31 A.E. Polinichenko "Antibiotic Resistance of Pesticide-Resistant Bacteria"
P32 A.A. Polkovskaya "Analysis of Microbial Communities of Skin and Habitat of Amphibians and Reptiles"
P33 I.V. Popov "Streptomyces albidoflavus SM254: Genomic Markers of Counteraction to White-Nose Syndrome in Cheiroptera"
P34 N.A. Pronovich "Bacterial Rhizobiome of Wheat and Its Wild Relative — Couch Grass as a Pool of New Biocontrol Agents"
P35 N.V. Razvalieva "Efficiency of Chemical Mutagenesis in Enhancing the Survival of Candida maltosa Producer Strains"
P36 L.S. Semishova "Assessment of the Bacteriocinogenic Potential of Thermophilic Strains of the Genus Bacillus"
P37 G.M. Sergeev "Comparison of Bioinformatics Programs for Solving a Number of Current Tasks in Mycobacterium tuberculosis Genomic Epidemiology"
P38 D.V. Sidorov "Expanding the Family of Mirror Proteorhodopsins and Searching for a Zinc-Binding Site Among Microbial Rhodopsins"
P39 N.A. Smolyanova "Structural Features of Cel7465 Cellulase Revealed by Small-Angle X-Ray Scattering, Prospects for Biotechnological Application"
P40 D.V. Smutin "These are the Wrong Bees: Predicting Bee Pathogens from Hive Physical Characteristics Using Bee-AI"
P41 M.N. Sokolov "Spread of Quorum Quenching Enzymes in Prokaryotes"
P42 A.D. Suleymanova "Sequencing and Analysis of Soil Isolate Genomes of Pantoea brenneri"
P43 M.N. Tereshin "Biocatalytic Method for TEV Protease Immobilization"
P44 T.I. Triska "Study of the Effect of Single Subunit SRP14 and Fusion Protein SRP14-9 Expression on Recombinant Protein Secretion by CHO Cells"
P45 E.V. Trushlis "Induction of Hormesis by Titanium Dioxide Nanoparticles in Probiotic Bacteria: Molecular Mechanisms and Potential for Enhancing Bacteriocin Synthesis"
P46 N.Yu. Chernov "Ribosomal Proteins RPL7, RPL12, RPL15 as Potential Targets for Phenazine Compounds"
P47 A.S. Chernyshova "Development of an NGS Amplification Panel for Hepatitis C Virus Sequencing"
P48 M.I. Shaladonova "Codon Harmonization as a Promising Strategy for Enhancing the Expression of Human Aromatase in E. coli Cells"
P49 E.T. Abimbola "Amino Acid Pathway-Based Prediction of Microbial Species Against Clostridioides difficile Colonization: A Computational Approach"
P50 M.B. Bekiyeva "Mathematical Models of Microbial Genome Evolution"
P52 S. Panaiotov "Microbial Biodiversity and Models of Blood Microbiota Division in Healthy Individuals"
P53 I.A. Volynkina "Azithromycin-Benzoxaborole Conjugates Overcome Inducible Resistance to Macrolide Antibiotics"
P02 M.D. Aleksandrov "Investigation of Symbiotic Relationships in Microbial Communities in Acidic-Saline Environments"
P03 V.M. Andreevskaya "Study of Phylloplane Microorganism Diversity on Solanaceous Crops"
P04 M.A. Anisimova "Assessment of CADM1, MAL, and PAX1 Gene Methylation by ddPCR in HPV-Associated Cervical Neoplasias"
P05 A.I. Akhmadeeva "Cloning of the Endolysin Gene of Pseudomonas Phage Ka2 and Characterization of the Recombinant Protein"
P06 G.A. Ashniyev "The Glycanolytic Potential of Intestinal Prevotella: In Silico Reconstruction of Polysaccharide Degradation Pathways"
P07 E.A. Bagrova "Investigation of the Structure of Cellulosomemonoxygenases from the Phytopathogenic Fungus Microdochium nivale Using Molecular Modeling"
P08 M.V. Baskova "Use of the SpyCatcher-SpyTag System for Obtaining Affinity Sorbents on Polymethacrylate and Agarose Matrices"
P09 L.R. Biktasheva "Influence of Physicochemical Parameters on the Composition of Bacterial Communities in Oil-Producing Wells of the Romashkinskoye Field"
P10 S.R. Gazizova "Genome Analysis of the Bacillus thuringiensis VL5 Strain with Antagonistic Activity Against Phytopathogenic Fungi"
P11 A.I. Gilmutdinova "Creation and Characterization of a CRISPR-Edited Bacillus subtilis Strain with an Inactivated dhbF Gene Responsible for Siderophore Production"
P12 D.M. Golova "Isolation of Coliphages from Moscow City Soils"
P13 A.S. Gordeev "Remediation of Oil-Contaminated Soils with Biosurfactants Produced by the Strain Nocardiopsis sp. 3mo"
P14 E.N. Dekhanova "Genetic Determinants of Polyextremophily in the Exiguobacterium chiriqhucha S12 Strain"
P15 A.M. Dyubar "Isolation of Sulfate-Reducing Microorganisms Resistant to Low pH and High Metal Concentrations"
P16 Yu.V. Dyubo "Comparative Analysis of Methylomes of Pectobacterium versatile Strains"
P17 P.A. Zaitsev "Functional-Metagenomic Analysis of Algocenoses in Natural and Artificial Eutrophicated Systems"
P18 A.A. Zimina "Evolution and Diversity of 18S rRNA in Plasmodium falciparum and the Impact of SNPs on Malaria Pathogenesis"
P19 A.B. Ivanov "Transcriptomic Profiling of Dopaminergic Neurons Derived from Induced Pluripotent Stem Cells in Parkinson's Disease"
P20 O.P. Ikkert "Soil Pseudomonas Strain Resistance to Glyphosate: Biochemical and Genetic Aspects"
P21 R.R. Islamov "Heavy Metal Resistance in Pantoea brenneri Strains"
P22 A.V. Kobets "Study of Microorganisms from Arctic Snow and Water"
P23 A.V. Kovalenko "Influence of Agricultural Practices on Carbon Cycle Metabolic Pathways in Leached Chernozem of the Ob Region"
P24 A.D. Kozlova "Assessment of the Influence of Folate Cycle Gene Polymorphisms (MTHFR, MTR, MTRR) on the Development of ASD in Children"
P25 A.N. Kolyadin "Adaptive Responses of Microorganisms to Hypomagnetic Conditions"
P26 V.I. Kotsarev "Assessment of Competence State Regulator Gene Expression in the Wild-Type Bacillus subtilis R1 Strain"
P27 M.A. Krivonosova "Features of Gut Microbiota in Patients with Type 2 Diabetes Mellitus and the Impact of Hyperbaric Oxygen on It"
P28 O.D. Lanovaya "Investigation of the Role of Integrons in the Spread of Antibiotic Resistance Genes in Azov Sea Bottom Sediments"
P29 P.A. Mirko "Analysis of Genomes of Uncultivated Bacteria from Chernozem Soil Metagenomes for Genetic Markers of Oligotrophy"
P30 E.M. Pleshko "Comparative Genomic Analysis of Four Kocuria Strains"
P31 A.E. Polinichenko "Antibiotic Resistance of Pesticide-Resistant Bacteria"
P32 A.A. Polkovskaya "Analysis of Microbial Communities of Skin and Habitat of Amphibians and Reptiles"
P33 I.V. Popov "Streptomyces albidoflavus SM254: Genomic Markers of Counteraction to White-Nose Syndrome in Cheiroptera"
P34 N.A. Pronovich "Bacterial Rhizobiome of Wheat and Its Wild Relative — Couch Grass as a Pool of New Biocontrol Agents"
P35 N.V. Razvalieva "Efficiency of Chemical Mutagenesis in Enhancing the Survival of Candida maltosa Producer Strains"
P36 L.S. Semishova "Assessment of the Bacteriocinogenic Potential of Thermophilic Strains of the Genus Bacillus"
P37 G.M. Sergeev "Comparison of Bioinformatics Programs for Solving a Number of Current Tasks in Mycobacterium tuberculosis Genomic Epidemiology"
P38 D.V. Sidorov "Expanding the Family of Mirror Proteorhodopsins and Searching for a Zinc-Binding Site Among Microbial Rhodopsins"
P39 N.A. Smolyanova "Structural Features of Cel7465 Cellulase Revealed by Small-Angle X-Ray Scattering, Prospects for Biotechnological Application"
P40 D.V. Smutin "These are the Wrong Bees: Predicting Bee Pathogens from Hive Physical Characteristics Using Bee-AI"
P41 M.N. Sokolov "Spread of Quorum Quenching Enzymes in Prokaryotes"
P42 A.D. Suleymanova "Sequencing and Analysis of Soil Isolate Genomes of Pantoea brenneri"
P43 M.N. Tereshin "Biocatalytic Method for TEV Protease Immobilization"
P44 T.I. Triska "Study of the Effect of Single Subunit SRP14 and Fusion Protein SRP14-9 Expression on Recombinant Protein Secretion by CHO Cells"
P45 E.V. Trushlis "Induction of Hormesis by Titanium Dioxide Nanoparticles in Probiotic Bacteria: Molecular Mechanisms and Potential for Enhancing Bacteriocin Synthesis"
P46 N.Yu. Chernov "Ribosomal Proteins RPL7, RPL12, RPL15 as Potential Targets for Phenazine Compounds"
P47 A.S. Chernyshova "Development of an NGS Amplification Panel for Hepatitis C Virus Sequencing"
P48 M.I. Shaladonova "Codon Harmonization as a Promising Strategy for Enhancing the Expression of Human Aromatase in E. coli Cells"
P49 E.T. Abimbola "Amino Acid Pathway-Based Prediction of Microbial Species Against Clostridioides difficile Colonization: A Computational Approach"
P50 M.B. Bekiyeva "Mathematical Models of Microbial Genome Evolution"
P52 S. Panaiotov "Microbial Biodiversity and Models of Blood Microbiota Division in Healthy Individuals"
P53 I.A. Volynkina "Azithromycin-Benzoxaborole Conjugates Overcome Inducible Resistance to Macrolide Antibiotics"
October 26, Sunday
09:00−09:10 Opening Remarks
09:10−09:50 Lecture "Defence and Counter-Defence Strategies in the Phage-Bacterium Arms Race"
Peter Fineran
Professor, University of Otago, New Zealand
09:50−10:30 Lecture "National Genetic Initiative"
O.S. Musharova
PhD, Head of the Biomedical Department of the «Biotech Campus»
10:30−11:00 Coffee Break
11:00−12:20 Oral Session Presentations
11:00−11:10 A.A. Derzhav
"Tin: A Minimalist Abortive PD-(D/E)XK Nuclease Fusing Sensor and Effector Functions for Anti-Phage Defense"
11:10−11:20 E.A. Nikolaychik
"Current Capabilities and Prospects for Whole-Genome Analysis of Bacterial Transcription Control Signals"
11:20−11:30 M.A. Beskrovnaya
"Analysis of the Activity of Prokaryotic Argonaute Proteins Associated with SMEK Nuclease"
11:30−11:40 A.D. Livensky
"Assessment of All aa-tRNA Levels in vivo and in vitro Using HPLC-MS"
11:40−11:50 Yu.V. Skvortsova
"Targeting Mycobacterium tuberculosis Small RNA with Antisense Oligonucleotides Modulates Immune Response During Infection"
11:50−12:00 A.D. Bolatchiev
"Mining Peptide Antibiotics from the Proteome of Blautia producta (a Component of the Human Microbiome)"
12:00−12:10 A.I. Andriyanov
"SAMase of Bacteriophage T3: A Triple Strike Against Restriction-Modification Systems"
12:10−12:20 M.S. Fedorova
"Pseudomonas Bacteriophages for Antimicrobial Therapy of Pseudomonas Infections"
12:20−13:00 Lecture "Bacterial Phytopathogens: Diversity, Diagnostics, and Prospects of Bacteriophage Application for Biocontrol"
K.A. Miroshnikov
D.Sc. in Chemistry, Corresponding Member of RAS, Head of the Laboratory of Molecular Bioengineering, M.M. Shemyakin and Yu.A. Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry, RAS
13:00−14:00 Lunch
14:00−14:30 Lecture "Prevalence and genetic diversity of mammalian coronaviruses in Russia: a bridge between Europe and Asia"
A. S. Speranskaya
Ph.D. in Biological Sciences, Acting Head of the Laboratory "DNA Methylome and Transcriptome Editing", Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences.
14:30−16:30 Poster Session II
16:30−17:00 Closing Ceremony
09:10−09:50 Lecture "Defence and Counter-Defence Strategies in the Phage-Bacterium Arms Race"
Peter Fineran
Professor, University of Otago, New Zealand
09:50−10:30 Lecture "National Genetic Initiative"
O.S. Musharova
PhD, Head of the Biomedical Department of the «Biotech Campus»
10:30−11:00 Coffee Break
11:00−12:20 Oral Session Presentations
11:00−11:10 A.A. Derzhav
"Tin: A Minimalist Abortive PD-(D/E)XK Nuclease Fusing Sensor and Effector Functions for Anti-Phage Defense"
11:10−11:20 E.A. Nikolaychik
"Current Capabilities and Prospects for Whole-Genome Analysis of Bacterial Transcription Control Signals"
11:20−11:30 M.A. Beskrovnaya
"Analysis of the Activity of Prokaryotic Argonaute Proteins Associated with SMEK Nuclease"
11:30−11:40 A.D. Livensky
"Assessment of All aa-tRNA Levels in vivo and in vitro Using HPLC-MS"
11:40−11:50 Yu.V. Skvortsova
"Targeting Mycobacterium tuberculosis Small RNA with Antisense Oligonucleotides Modulates Immune Response During Infection"
11:50−12:00 A.D. Bolatchiev
"Mining Peptide Antibiotics from the Proteome of Blautia producta (a Component of the Human Microbiome)"
12:00−12:10 A.I. Andriyanov
"SAMase of Bacteriophage T3: A Triple Strike Against Restriction-Modification Systems"
12:10−12:20 M.S. Fedorova
"Pseudomonas Bacteriophages for Antimicrobial Therapy of Pseudomonas Infections"
12:20−13:00 Lecture "Bacterial Phytopathogens: Diversity, Diagnostics, and Prospects of Bacteriophage Application for Biocontrol"
K.A. Miroshnikov
D.Sc. in Chemistry, Corresponding Member of RAS, Head of the Laboratory of Molecular Bioengineering, M.M. Shemyakin and Yu.A. Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry, RAS
13:00−14:00 Lunch
14:00−14:30 Lecture "Prevalence and genetic diversity of mammalian coronaviruses in Russia: a bridge between Europe and Asia"
A. S. Speranskaya
Ph.D. in Biological Sciences, Acting Head of the Laboratory "DNA Methylome and Transcriptome Editing", Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences.
14:30−16:30 Poster Session II
16:30−17:00 Closing Ceremony
P01 M.V. Aleksandrova "The Role of Phage tRNAs in Evading the Bacterial PARIS System"
P02 M.K. Aliyeva "Study of the Activity of a Cas4-like Nuclease in Complex with a Prokaryotic Argonaute Protein"
P03 A.A. Anikin "Development of an Automated Algorithm for Analyzing High-Resolution Melting Curve Data of 16S rRNA Gene Variable Regions for Microbiome Composition Profiling"
P04 Yu.A. Antakova "Why Does Xanthomonas campestris pv. campestris Need TAL Effectors?"
P05 L.A. Arslan "Study of Gut Microbiota in Breast Cancer Patients in Remission After Chemotherapy"
P06 A.L. Arkhipova "Molecular Genetic Analysis of Hybrid Plasmids from Clinical Isolates of Klebsiella pneumoniae"
P07 I.A. Balazh "Optimization of the Cytometric Fingerprinting Methodology for Microbiota and Its Application for Monitoring the State of an in vitro Gut Microbiota Model"
P08 M.A. Belousov "Viral DNA Mimic Protein Inactivates Nucleoid Binding Protein HU"
P09 S.Yu. Belukhina "Specificity and the Mechanism of tRNA Cleavage by the TOPRIM Domain of PARIS Immunity System Effector AriB"
P10 O.S. Bychenko "Immunomodulatory Role of Extracellular Vesicles from Macrophages Infected with Mycobacterium abscessus"
P11 D.M. Golofeeva "Novel Immunity Proteins Encoded by Human Gut Commensal Escherichia coli HS"
P12 K.S. Bondareva "Analysis of the Genome of the Mutant Strain B-162/2 Pseudomonas chlororaphis subsp. aurantiaca and Identification of Mutations Providing Overproduction and Resistance to Its Own Phenazines"
P13 O.A. Danilova "Microevolutionary Processes in the Genomes of Resident Strains of Human Gut Microbiota: Analysis of Single Nucleotide Polymorphisms"
P14 A.O. Demkina "In situ Capture of Genomic DNA Breaks Generated by Restriction Nucleases"
P15 A.A. Derzhav "RecBCD and Anti-Phage Immunity − an OLD Misleading Story"
P16 A.A. Dmitriev "Gene 42 from Bacteriophage phiFa Turned Out to be an Endotoxin for E. coli"
P17 O. Dorozh "Fun/Z is an Abortive Immunity System Related to Archaeal and Eukaryotic Replication Component"
P18 A.Yu. Drobyazko "BREX Defense and Methylation Requires Assembly of Multicomponent Complexes"
P19 E.G. Ilyina "Optimization of Cultivation Conditions and DNA Isolation Protocols from Commercial Probiotic Strains"
P20 A.V. Kartashova "Generation of a Panel of Pseudomonas aeruginosa Knockout Mutants by Reverse Genetics Methods to Study the Role of Extracellular Matrix Proteins in Biofilm Formation"
P21 S.Yu. Kozlova "Interaction Between Restriction-Modification Systems and RecBCD Enzyme in Phage Defense"
P22 A.D. Kozlova "Diet-Dependent Variation in Gut Microbiomes of Canadian Honey Bees (Apis mellifera)"
P23 V. Kolotova "Viral Kinases: From Host Takeover to Bacterial Immunity Modulation"
P24 A.M. Komyakova "Selection of Signal Peptides for Directed Secretion of Recombinant Proteins in Escherichia coli"
P25 O. Kotovskaya "Exploring the Diversity of Host-Takeover and Immune Evasion Genes in Specific Hot spots of Bacteriophage Genomes"
P26 K.A. Miroshnikova "Bacterial Microbiome of Cryoturbated Arctic Soils"
P27 Yu.I. Nechaeva "Genome Analysis of the Halotolerant Strain Rhodococcus sp. 5A-K4 - an Active Degrader of Phthalates"
P28 E.M. Nikiforova "PAM-Independent Cas12a Detection of Specific LAMP Products by Targeting Amplicon Loops"
P29 K.A. Onasenko "Ability to Utilize Organosulfonates by Bacteria of the Genera Bacillus and Paenibacillus under Single-Carbon Nutrition Conditions and Their Genetic Potential"
P30 S. Panaiotov "Fungiome Profiling in Patients with Pulmonary Sarcoidosis Using Targeted Sequencing of Biopsies, Bronchoalveolar Lavage (BAL), and Blood Samples"
P31 S. Panaiotov "Bacterial Community Analysis of Veryovkina Cave"
P32 M.D. Pakhomova "Identification of the Ogataea polymorpha Gene Encoding an α-1,2-Mannosyltransferase that Affects Orthovanadate Resistance and the Secretory Protein Folding Process"
P33 A.V. Pashintseva "Prophage λ Encodes Septu Immunity System that is Activated by SSB Protein of the Phage T4"
P34 E.P. Pulikova "Adaptive Potential of Nitrifiers to Long-Term Soil Contamination with Zinc"
P35 I.A. Putirov "Bacteriophage Theo - A New Species for Biocontrol of Phytopathogenic Rhizobium spp."
P36 V.O. Pyrkin "Metabolic Potential of Microbial Communities in the Barents and Pechora Seas for Hydrocarbon Biodegradation"
P37 V.V. Rozantseva "Use of Fluorescent Reporter Proteins to Study the Metabolism of Corynebacterium glutamicum"
P38 A.P. Sapozhnikova "Characteristics of the SMC Complex of Ureaplasma parvum"
P39 M. Skutel "BREX Immunity Relies on Signal Transduction via ORC/STAND Domain of BrxC Protein and Nuclease Activity of BrxZ Effector"
P40 A. Smirnov "Type IV BREX is a Phosphorothioate-Based Anti-Phage Immunity System"
P41 D.V. Smutin "They Make the Wrong Honey: Pathological Metagenomics of the Beehive"
P42 L.V. Sokolnickova "Generation of a Pantoea brenneri 3.2 Strain with a Deleted Indole-3-Pyruvate Decarboxylase (ipdC) Gene and Study of Its Properties"
P43 D.V. Taranenko "AcrIE9 is a Potent Inhibitor of Escherichia coli Type IE CRISPR-Cas"
P44 M.O. Taratynova "Methane Bioconversion into the High-Value Carotenoid Canthaxanthin Using Methylococcus capsulatus and Genetically Modified Yarrowia lipolytica"
P45 D.A. Troshina "Genomic Diversity of Limosilactobacillus fermentum"
P46 M.A. Uvarova "The Role of Anti-Immune Proteins in Suppressing the Immune System in Their Native Context"
P47 V.D. Udovichenko "Engineering Whole-Cell Lux Biosensors in Bacillus subtilis Induced by Membrane Damage"
P48 T.A. Khabibullin "Investigation of Mannitol Catabolism in Yarrowia lipolytica Yeast"
P49 T.S. Khvostikov "Eco1 Retron is Controlled by Nucleoid-Binding Protein H-NS"
P50 Yu.R. Tsarkova "Genomic Potential of the Achromobacter sp. DK10 Strain for Degradation of Persistent Organic Compounds"
P51 A.A. Shenfeld "Anti-Sense RNA aO Derived from the Replication Origin Controls Bacteriophage Lambda Infection"
P52 A.E. Shipunova "Investigation of AID/APOBEC-Dependent Mutagenesis Patterns in the Saccharomyces cerevisiae Genome with Deletions of HST3 and HST4 Genes"
P53 I.A. Shokodko "Evolutionary Analysis of Bacterial Homologues of the Sirtuin Protein Family"
P54 D.D. Yanovskaya "Dual Activity of Antidefense Proteins ArdB and AcrIC11 Against Restriction-Modification and CRISPR-Cas Systems"
P02 M.K. Aliyeva "Study of the Activity of a Cas4-like Nuclease in Complex with a Prokaryotic Argonaute Protein"
P03 A.A. Anikin "Development of an Automated Algorithm for Analyzing High-Resolution Melting Curve Data of 16S rRNA Gene Variable Regions for Microbiome Composition Profiling"
P04 Yu.A. Antakova "Why Does Xanthomonas campestris pv. campestris Need TAL Effectors?"
P05 L.A. Arslan "Study of Gut Microbiota in Breast Cancer Patients in Remission After Chemotherapy"
P06 A.L. Arkhipova "Molecular Genetic Analysis of Hybrid Plasmids from Clinical Isolates of Klebsiella pneumoniae"
P07 I.A. Balazh "Optimization of the Cytometric Fingerprinting Methodology for Microbiota and Its Application for Monitoring the State of an in vitro Gut Microbiota Model"
P08 M.A. Belousov "Viral DNA Mimic Protein Inactivates Nucleoid Binding Protein HU"
P09 S.Yu. Belukhina "Specificity and the Mechanism of tRNA Cleavage by the TOPRIM Domain of PARIS Immunity System Effector AriB"
P10 O.S. Bychenko "Immunomodulatory Role of Extracellular Vesicles from Macrophages Infected with Mycobacterium abscessus"
P11 D.M. Golofeeva "Novel Immunity Proteins Encoded by Human Gut Commensal Escherichia coli HS"
P12 K.S. Bondareva "Analysis of the Genome of the Mutant Strain B-162/2 Pseudomonas chlororaphis subsp. aurantiaca and Identification of Mutations Providing Overproduction and Resistance to Its Own Phenazines"
P13 O.A. Danilova "Microevolutionary Processes in the Genomes of Resident Strains of Human Gut Microbiota: Analysis of Single Nucleotide Polymorphisms"
P14 A.O. Demkina "In situ Capture of Genomic DNA Breaks Generated by Restriction Nucleases"
P15 A.A. Derzhav "RecBCD and Anti-Phage Immunity − an OLD Misleading Story"
P16 A.A. Dmitriev "Gene 42 from Bacteriophage phiFa Turned Out to be an Endotoxin for E. coli"
P17 O. Dorozh "Fun/Z is an Abortive Immunity System Related to Archaeal and Eukaryotic Replication Component"
P18 A.Yu. Drobyazko "BREX Defense and Methylation Requires Assembly of Multicomponent Complexes"
P19 E.G. Ilyina "Optimization of Cultivation Conditions and DNA Isolation Protocols from Commercial Probiotic Strains"
P20 A.V. Kartashova "Generation of a Panel of Pseudomonas aeruginosa Knockout Mutants by Reverse Genetics Methods to Study the Role of Extracellular Matrix Proteins in Biofilm Formation"
P21 S.Yu. Kozlova "Interaction Between Restriction-Modification Systems and RecBCD Enzyme in Phage Defense"
P22 A.D. Kozlova "Diet-Dependent Variation in Gut Microbiomes of Canadian Honey Bees (Apis mellifera)"
P23 V. Kolotova "Viral Kinases: From Host Takeover to Bacterial Immunity Modulation"
P24 A.M. Komyakova "Selection of Signal Peptides for Directed Secretion of Recombinant Proteins in Escherichia coli"
P25 O. Kotovskaya "Exploring the Diversity of Host-Takeover and Immune Evasion Genes in Specific Hot spots of Bacteriophage Genomes"
P26 K.A. Miroshnikova "Bacterial Microbiome of Cryoturbated Arctic Soils"
P27 Yu.I. Nechaeva "Genome Analysis of the Halotolerant Strain Rhodococcus sp. 5A-K4 - an Active Degrader of Phthalates"
P28 E.M. Nikiforova "PAM-Independent Cas12a Detection of Specific LAMP Products by Targeting Amplicon Loops"
P29 K.A. Onasenko "Ability to Utilize Organosulfonates by Bacteria of the Genera Bacillus and Paenibacillus under Single-Carbon Nutrition Conditions and Their Genetic Potential"
P30 S. Panaiotov "Fungiome Profiling in Patients with Pulmonary Sarcoidosis Using Targeted Sequencing of Biopsies, Bronchoalveolar Lavage (BAL), and Blood Samples"
P31 S. Panaiotov "Bacterial Community Analysis of Veryovkina Cave"
P32 M.D. Pakhomova "Identification of the Ogataea polymorpha Gene Encoding an α-1,2-Mannosyltransferase that Affects Orthovanadate Resistance and the Secretory Protein Folding Process"
P33 A.V. Pashintseva "Prophage λ Encodes Septu Immunity System that is Activated by SSB Protein of the Phage T4"
P34 E.P. Pulikova "Adaptive Potential of Nitrifiers to Long-Term Soil Contamination with Zinc"
P35 I.A. Putirov "Bacteriophage Theo - A New Species for Biocontrol of Phytopathogenic Rhizobium spp."
P36 V.O. Pyrkin "Metabolic Potential of Microbial Communities in the Barents and Pechora Seas for Hydrocarbon Biodegradation"
P37 V.V. Rozantseva "Use of Fluorescent Reporter Proteins to Study the Metabolism of Corynebacterium glutamicum"
P38 A.P. Sapozhnikova "Characteristics of the SMC Complex of Ureaplasma parvum"
P39 M. Skutel "BREX Immunity Relies on Signal Transduction via ORC/STAND Domain of BrxC Protein and Nuclease Activity of BrxZ Effector"
P40 A. Smirnov "Type IV BREX is a Phosphorothioate-Based Anti-Phage Immunity System"
P41 D.V. Smutin "They Make the Wrong Honey: Pathological Metagenomics of the Beehive"
P42 L.V. Sokolnickova "Generation of a Pantoea brenneri 3.2 Strain with a Deleted Indole-3-Pyruvate Decarboxylase (ipdC) Gene and Study of Its Properties"
P43 D.V. Taranenko "AcrIE9 is a Potent Inhibitor of Escherichia coli Type IE CRISPR-Cas"
P44 M.O. Taratynova "Methane Bioconversion into the High-Value Carotenoid Canthaxanthin Using Methylococcus capsulatus and Genetically Modified Yarrowia lipolytica"
P45 D.A. Troshina "Genomic Diversity of Limosilactobacillus fermentum"
P46 M.A. Uvarova "The Role of Anti-Immune Proteins in Suppressing the Immune System in Their Native Context"
P47 V.D. Udovichenko "Engineering Whole-Cell Lux Biosensors in Bacillus subtilis Induced by Membrane Damage"
P48 T.A. Khabibullin "Investigation of Mannitol Catabolism in Yarrowia lipolytica Yeast"
P49 T.S. Khvostikov "Eco1 Retron is Controlled by Nucleoid-Binding Protein H-NS"
P50 Yu.R. Tsarkova "Genomic Potential of the Achromobacter sp. DK10 Strain for Degradation of Persistent Organic Compounds"
P51 A.A. Shenfeld "Anti-Sense RNA aO Derived from the Replication Origin Controls Bacteriophage Lambda Infection"
P52 A.E. Shipunova "Investigation of AID/APOBEC-Dependent Mutagenesis Patterns in the Saccharomyces cerevisiae Genome with Deletions of HST3 and HST4 Genes"
P53 I.A. Shokodko "Evolutionary Analysis of Bacterial Homologues of the Sirtuin Protein Family"
P54 D.D. Yanovskaya "Dual Activity of Antidefense Proteins ArdB and AcrIC11 Against Restriction-Modification and CRISPR-Cas Systems"
P55 B. Adelere "Wadjet Defense System Target Both Plasmids and Bacteriophages"
s'P51 Li Xiangpu "Rpl36 Protein as a Potential New Target for Phenazine Compounds in Eukaryotic Cells"
October 27, Monday
Closed Roundtable with Industry Representatives
О конференции
Лаборатория Анализа Метагеномов и Центр молекулярной и клеточной биологии Сколтеха приглашают к участию в IV конференции «Геномика, метагеномика и молекулярная биология микроорганизмов» студентов, аспирантов, ученых, специализирующихся в области геномики, метагеномики и молекулярной биологии микроорганизмов. Конференция направлена на обмен знаниями и опытом, обсуждение результатов новейших научных проектов, содействие сотрудничеству между ведущими специалистами в области широкого круга тем, связанных с генетикой, молекулярной биологией и биохимией микроорганизмов, включая трансляционную микробиологию и технологии геномного редактирования. Программа конференции будет включать пленарные лекции ведущих ученых, устную и постерную сессии, возможности для общения (кофе-брейки, социальная программа). Подробная программа конференции будет опубликована немного позже.
Рабочий язык конференции – русский, английский.
Конференция пройдёт 25-26 октября 2025 года в Сколковском Институте Науки и Технологий (Москва, Территория Инновационного Центра “Сколково”, Большой бульвар д. 30, стр. 1).
Для участия необходимо заполнить форму, включающую информацию об участнике, и загрузить тезисы доклада. Организационный комитет рассмотрит все поступившие заявки и пригласит участников, чьи работы будут наиболее интересны и наиболее удачно вписываются в тематику конференции. Тезисы будут рекомендованы оргкомитетом для презентации в рамках устной или постерной сессии конференции.
Рабочий язык конференции – русский, английский.
Конференция пройдёт 25-26 октября 2025 года в Сколковском Институте Науки и Технологий (Москва, Территория Инновационного Центра “Сколково”, Большой бульвар д. 30, стр. 1).
Для участия необходимо заполнить форму, включающую информацию об участнике, и загрузить тезисы доклада. Организационный комитет рассмотрит все поступившие заявки и пригласит участников, чьи работы будут наиболее интересны и наиболее удачно вписываются в тематику конференции. Тезисы будут рекомендованы оргкомитетом для презентации в рамках устной или постерной сессии конференции.
About the Conference
The Laboratory of Metagenome Analysis and the Center for Molecular and Cellular Biology of Skoltech invite undergraduate and PhD students, scientists specializing in the fields of genomics, metagenomics and molecular biology of microorganisms to participate in the IV conference “Genomics, Metagenomics and Molecular Biology of Microorganisms” (IV GMMMC). The conference is aimed at sharing knowledge and experience, discussing the results of the latest scientific projects, promoting cooperation between leading experts in the wide range of topics related to genetics, molecular biology and biochemistry of microorganisms, including translational microbiology and genome editing technologies. The program of the conference will include keynote lectures, oral and poster sessions, networking opportunities (coffee breaks, social program). The detailed program will follow.
The working languages of the conference are Russian and English.
The conference will be held on October 25-26, 2025 at the Skolkovo Institute of Science and Technology (Moscow, Territory of the Skolkovo Innovation Center, Bolshoy Boulevard 30, building 1).
To participate, you should fill out the form below that includes information about the participant and upload the abstract. The organizing committee will review all received applications and invite participants whose work is the most interesting and best fit into the scientific topic of the conference. Abstracts will be recommended by the organizing committee for presentation during the oral or poster session of the conference.
The working languages of the conference are Russian and English.
The conference will be held on October 25-26, 2025 at the Skolkovo Institute of Science and Technology (Moscow, Territory of the Skolkovo Innovation Center, Bolshoy Boulevard 30, building 1).
To participate, you should fill out the form below that includes information about the participant and upload the abstract. The organizing committee will review all received applications and invite participants whose work is the most interesting and best fit into the scientific topic of the conference. Abstracts will be recommended by the organizing committee for presentation during the oral or poster session of the conference.
Climbers on Mount Rainier
4K Timelapse Video
Лекции приглашённых лекторов/Keynote lectures
Defence and counter-defence strategies in the phage-bacterium arms race
Peter Fineran
Peter Fineran is a Professor at the University of Otago, New Zealand and leads the Phage-host interactions (Phi) laboratory. He obtained a BSc (Hons) in Biochemistry from the University of Canterbury, NZ, then completed his PhD and post-doctoral training at the University of Cambridge, UK. Peter’s group researches the interactions between bacteriophages, other mobile elements and their bacterial hosts – in particular in the area of CRISPR-Cas and other phage defence systems. His team has also worked extensively on strategies used by phages to evade phage defence systems as well as the development of phages in therapeutic applications. Peter has published approximately 140 articles, has filed multiple patents and received numerous awards in recognition of his research, including the Fleming Prize from the Microbiology Society, UK. He is a Fellow of the Royal Society of New Zealand and a current James Cook Research Fellow.
Peter Fineran
Peter Fineran is a Professor at the University of Otago, New Zealand and leads the Phage-host interactions (Phi) laboratory. He obtained a BSc (Hons) in Biochemistry from the University of Canterbury, NZ, then completed his PhD and post-doctoral training at the University of Cambridge, UK. Peter’s group researches the interactions between bacteriophages, other mobile elements and their bacterial hosts – in particular in the area of CRISPR-Cas and other phage defence systems. His team has also worked extensively on strategies used by phages to evade phage defence systems as well as the development of phages in therapeutic applications. Peter has published approximately 140 articles, has filed multiple patents and received numerous awards in recognition of his research, including the Fleming Prize from the Microbiology Society, UK. He is a Fellow of the Royal Society of New Zealand and a current James Cook Research Fellow.
Защитные и антизащитные стратегии в гонке вооружений между бактериями и фагами
Питер Финеран – профессор Университета Отаго (Новая Зеландия), возглавляет лабораторию взаимодействия фага и хозяина (Phage-host interactions, Phi). Он получил степень бакалавра (с отличием) по биохимии в университете Кентербери (Новая Зеландия), затем защитил докторскую диссертацию и прошел постдокторскую стажировку в Кембриджском университете (Великобритания).
Группа Питера изучает взаимодействие между бактериофагами, другими мобильными элементами и их бактериальными хозяевами – в частности, в области CRISPR-Cas и других защитных систем фагов. Его группа также активно работает над стратегиями, используемыми фагами для обхода систем защиты фагов, а также над разработкой фагов для терапевтического применения. Питер опубликовал около 140 статей, оформил множество патентов и получил множество наград в знак признания своих исследований, включая премию Флеминга от Микробиологического общества Великобритании. Он является членом Королевского общества Новой Зеландии и действующим членом исследовательского общества Джеймса Кука.
Питер Финеран – профессор Университета Отаго (Новая Зеландия), возглавляет лабораторию взаимодействия фага и хозяина (Phage-host interactions, Phi). Он получил степень бакалавра (с отличием) по биохимии в университете Кентербери (Новая Зеландия), затем защитил докторскую диссертацию и прошел постдокторскую стажировку в Кембриджском университете (Великобритания).
Группа Питера изучает взаимодействие между бактериофагами, другими мобильными элементами и их бактериальными хозяевами – в частности, в области CRISPR-Cas и других защитных систем фагов. Его группа также активно работает над стратегиями, используемыми фагами для обхода систем защиты фагов, а также над разработкой фагов для терапевтического применения. Питер опубликовал около 140 статей, оформил множество патентов и получил множество наград в знак признания своих исследований, включая премию Флеминга от Микробиологического общества Великобритании. Он является членом Королевского общества Новой Зеландии и действующим членом исследовательского общества Джеймса Кука.
Специфичность антибиотиков, ингибирующих трансляцию, по отношению к последовательности мРНК
Сергиев Петр Владимирович – доктор химических наук, профессор, член-корреспондент РАН, и.о. директора НИИ ФХБ МГУ имени М.В. Ломоносова.
Основные направления исследований
Исследование функций неизученных ранее генов. Поиск и изучение антибиотиков, ингибирующих рибосому. Изучение ферментативной модификации рибосомы.
Исследование белков, отвечающих за модификацию и сборку митохондриальных рибосом.
Сергиев Петр Владимирович – доктор химических наук, профессор, член-корреспондент РАН, и.о. директора НИИ ФХБ МГУ имени М.В. Ломоносова.
Основные направления исследований
Исследование функций неизученных ранее генов. Поиск и изучение антибиотиков, ингибирующих рибосому. Изучение ферментативной модификации рибосомы.
Исследование белков, отвечающих за модификацию и сборку митохондриальных рибосом.
mRNA sequence specificity of translation inhibitors
Petr V. Sergiev – Doctor of Chemical Sciences, Professor, Corresponding Member of the RAS, Acting Director of the A.N. Belozersky Research Institute of Physico-Chemical Biology.
Main research areas
Study of functions of previously unexplored genes. Search and investigation of antibiotics that inhibit ribosomes. Study of enzymatic modification of ribosomes.
Research on proteins responsible for modification and assembly of mitochondrial ribosomes.
Petr V. Sergiev – Doctor of Chemical Sciences, Professor, Corresponding Member of the RAS, Acting Director of the A.N. Belozersky Research Institute of Physico-Chemical Biology.
Main research areas
Study of functions of previously unexplored genes. Search and investigation of antibiotics that inhibit ribosomes. Study of enzymatic modification of ribosomes.
Research on proteins responsible for modification and assembly of mitochondrial ribosomes.
Национальная генетическая инициатива
Мушарова Ольга Сергеевна – кандидат биологических наук, Начальник биомедицинского отдела ООО "Биотек кампус"
Основные направления исследований
Механизмы иммунитета бактерий, регуляция экспрессии генов прокариот, антибиотики и антибиотикорезистентность. Геномика и метагеномика.
Мушарова Ольга Сергеевна – кандидат биологических наук, Начальник биомедицинского отдела ООО "Биотек кампус"
Основные направления исследований
Механизмы иммунитета бактерий, регуляция экспрессии генов прокариот, антибиотики и антибиотикорезистентность. Геномика и метагеномика.
National Genetic Initiative
Olga S. Musharova – PhD, Head of the Biomedical Department of the «Biotech Campus».
Main research areas
Mechanisms of bacterial immunity, regulation of gene expression in prokaryotes, antibiotics and antibiotic resistance. Genomics and metagenomics.
Olga S. Musharova – PhD, Head of the Biomedical Department of the «Biotech Campus».
Main research areas
Mechanisms of bacterial immunity, regulation of gene expression in prokaryotes, antibiotics and antibiotic resistance. Genomics and metagenomics.
Древняя ДНК и история эпидемий
Михаил Сергеевич Гельфанд – доктор биологических наук, профессор, вице-президент по биомедицинским исследованиям Сколковского института науки и технологий (Сколтеха).
Основные направления исследований
Системная биология, функциональная и сравнительная геномика. Эволюция сплайсинга и редактирование транскриптов. Метагеномные исследования.
Михаил Сергеевич Гельфанд – доктор биологических наук, профессор, вице-президент по биомедицинским исследованиям Сколковского института науки и технологий (Сколтеха).
Основные направления исследований
Системная биология, функциональная и сравнительная геномика. Эволюция сплайсинга и редактирование транскриптов. Метагеномные исследования.
Ancient DNA and the History of Epidemics
Mikhail S. Gelfand – Professor, Vice-President for Biomedical Research Skolkovo Institute of Science and Technology (Skoltech)
Main research areas
Systems biology, functional and comparative genomics. The evolution of splicing and transcript editing. Metagenomic studies.
Mikhail S. Gelfand – Professor, Vice-President for Biomedical Research Skolkovo Institute of Science and Technology (Skoltech)
Main research areas
Systems biology, functional and comparative genomics. The evolution of splicing and transcript editing. Metagenomic studies.
Бактериальные фитопатогены: разнообразие, диагностика и перспективы применения бактериофагов для биоконтроля
Константин Анатольевич Мирошников – доктор химических наук, член-корреспондент РАН, заведующий лабораторией молекулярной биоинженерии Института биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН.
Основные направления исследований
Геномные, протеомные, структурные и эволюционные исследования бактериофагов. Изучение ферментов, гидролизующих пептидогликаны и полисахариды.
Константин Анатольевич Мирошников – доктор химических наук, член-корреспондент РАН, заведующий лабораторией молекулярной биоинженерии Института биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН.
Основные направления исследований
Геномные, протеомные, структурные и эволюционные исследования бактериофагов. Изучение ферментов, гидролизующих пептидогликаны и полисахариды.
Bacterial phytopathogens: diversity, diagnostics and prospects for the use of bacteriophages for biocontrol
Konstantin A. Miroshnikov – Doctor of Chemical Sciences, Corresponding Member of the RAS, Head of the Laboratory of molecular bioengineering Shemyakin-Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry.
Main research areas
Genomic, proteomic, structural and evolutionary studies of bacteriophages. Investigation of enzymes hydrolyzing peptidoglycans and polysaccharides.
Konstantin A. Miroshnikov – Doctor of Chemical Sciences, Corresponding Member of the RAS, Head of the Laboratory of molecular bioengineering Shemyakin-Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry.
Main research areas
Genomic, proteomic, structural and evolutionary studies of bacteriophages. Investigation of enzymes hydrolyzing peptidoglycans and polysaccharides.
Микробиота кишечника: ключевой игрок в системном здоровье и патологии
Беспятых Юлия Андреевна — кандидат биологических наук, руководитель Центра молекулярной медицины и диагностики, заведующая лабораторией молекулярной медицины ФГБУ ФНКЦ ФХМ им. Ю.М. Лопухина ФМБА России. Доцент кафедры экспертизы в допинг- и наркоконтроле РХТУ ИМ. Д.И. Менделеева. Главный внештатный специалист ЦФО ФМБА по клинической микробиологии и антибиотикорезистентности.
Основные направления исследований
Исследование молекулярных механизмов устойчивости патогенных бактерий, разработка методов идентификации и типирования патогенных бактерий. Исследование роли микробиома в патогенезе заболеваний.
Беспятых Юлия Андреевна — кандидат биологических наук, руководитель Центра молекулярной медицины и диагностики, заведующая лабораторией молекулярной медицины ФГБУ ФНКЦ ФХМ им. Ю.М. Лопухина ФМБА России. Доцент кафедры экспертизы в допинг- и наркоконтроле РХТУ ИМ. Д.И. Менделеева. Главный внештатный специалист ЦФО ФМБА по клинической микробиологии и антибиотикорезистентности.
Основные направления исследований
Исследование молекулярных механизмов устойчивости патогенных бактерий, разработка методов идентификации и типирования патогенных бактерий. Исследование роли микробиома в патогенезе заболеваний.
Gut Microbiota: A Key Player in Systemic Health and Disease
Julia A. Bespyatykh – MD, PhD, Head of the Center for Molecular Medicine and Diagnostics, Head of the Molecular Medicine Lab at Lopukhin Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine of Federal Medical Biological Agency. Associate Professor of the Department of Expertise in Doping and Drug Control of the Mendeleyev University of Chemical Technology of Russia. Chief specialist of the Central Federal District of the FMBA for Clinical Microbiology and Antibiotic Resistance
Main research areas
Investigation of molecular mechanisms of pathogenic bacterial resistance. Development of bacterial pathogen identification and typing methods. Study of microbiome role in disease pathogenesis
Julia A. Bespyatykh – MD, PhD, Head of the Center for Molecular Medicine and Diagnostics, Head of the Molecular Medicine Lab at Lopukhin Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine of Federal Medical Biological Agency. Associate Professor of the Department of Expertise in Doping and Drug Control of the Mendeleyev University of Chemical Technology of Russia. Chief specialist of the Central Federal District of the FMBA for Clinical Microbiology and Antibiotic Resistance
Main research areas
Investigation of molecular mechanisms of pathogenic bacterial resistance. Development of bacterial pathogen identification and typing methods. Study of microbiome role in disease pathogenesis
Биомембраны архей и бактерий: в чем сила и слабость?
Чугунов Антон Олегович – кандидат физико-математических наук, старший научный сотрудник Группы анализа структуры мембранных белков insilico Института биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН.
Основные направления исследований
Компьютерное моделирование мембранных белков, рецепторов и ионных каналов, интегрированных в биомембраны различного состава. Исследование взаимодействия рецепторов и лигандов. Изучение мембраноактивных антибиотиков.
Чугунов Антон Олегович – кандидат физико-математических наук, старший научный сотрудник Группы анализа структуры мембранных белков insilico Института биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН.
Основные направления исследований
Компьютерное моделирование мембранных белков, рецепторов и ионных каналов, интегрированных в биомембраны различного состава. Исследование взаимодействия рецепторов и лигандов. Изучение мембраноактивных антибиотиков.
Archaeal and Bacterial Biomembranes: Strengths and Weaknesses
Anton O. Chugunov – PhD, Senior research fellow of the Group of in silico analysis of membrane proteins structure, M.M. Shemyakin and Yu.A. Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry.
Main research areas
Computer modeling of membrane proteins, receptors and ion channels integrated into biomembranes. Investigation of the interaction of receptors and ligands. The study of membrane-active antibiotics.
Anton O. Chugunov – PhD, Senior research fellow of the Group of in silico analysis of membrane proteins structure, M.M. Shemyakin and Yu.A. Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry.
Main research areas
Computer modeling of membrane proteins, receptors and ion channels integrated into biomembranes. Investigation of the interaction of receptors and ligands. The study of membrane-active antibiotics.
Распространенность и генетическое разнообразие коронавирусов у млекопитающих в России: мост между Европой и Азией
Сперанская Анна Сергеевна – к.б.н., ВРИО зав.лаб. "ДНК-метилом и редактирование транскриптома" ИОГен РАН.
Основные направления исследований
Исследовательская деятельность лежит на стыке молекулярной вирусологии и современных омиксных технологий. Обладая экспертным опытом в NGS, полученным в процессе многолетней работы в ЦКП, в настоящее время специализируется на изучении возбудителей респираторных инфекций человека, SARS-CoV-2, а также коронавирусов и иных зоонозных вирусов из обитающих на территории России диких животных (прежде всего, рукокрылых и насекомоядных). Ключевые направления исследований – создание протоколов (с использованием геномных и протеомных данных) для обнаружения и характеристики биологических угроз здоровью человека, а также – поиск закономерностей в распространении вирусов с помощью млекопитающих по территории земного шара.
Сперанская Анна Сергеевна – к.б.н., ВРИО зав.лаб. "ДНК-метилом и редактирование транскриптома" ИОГен РАН.
Основные направления исследований
Исследовательская деятельность лежит на стыке молекулярной вирусологии и современных омиксных технологий. Обладая экспертным опытом в NGS, полученным в процессе многолетней работы в ЦКП, в настоящее время специализируется на изучении возбудителей респираторных инфекций человека, SARS-CoV-2, а также коронавирусов и иных зоонозных вирусов из обитающих на территории России диких животных (прежде всего, рукокрылых и насекомоядных). Ключевые направления исследований – создание протоколов (с использованием геномных и протеомных данных) для обнаружения и характеристики биологических угроз здоровью человека, а также – поиск закономерностей в распространении вирусов с помощью млекопитающих по территории земного шара.
Prevalence and genetic diversity of mammalian coronaviruses in Russia: a bridge between Europe and Asia
Speranskaya Anna Sergeevna – Ph.D. in Biological Sciences
Acting Head of the Laboratory "DNA Methylome and Transcriptome Editing", Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences
Main research areas
Her research lies at the intersection of molecular virology and modern omics technologies. With expert experience in NGS gained through years of work in a Central Collective Use Center, she currently specializes in the study of human respiratory pathogens, SARS-CoV-2, as well as coronaviruses and other zoonotic viruses from wild animals inhabiting Russia (primarily bats and insectivores). Key research areas include developing protocols (using genomic and proteomic data) for the detection and characterization of biological threats to human health, and investigating patterns of global virus spread by mammals.
Speranskaya Anna Sergeevna – Ph.D. in Biological Sciences
Acting Head of the Laboratory "DNA Methylome and Transcriptome Editing", Institute of General Genetics, Russian Academy of Sciences
Main research areas
Her research lies at the intersection of molecular virology and modern omics technologies. With expert experience in NGS gained through years of work in a Central Collective Use Center, she currently specializes in the study of human respiratory pathogens, SARS-CoV-2, as well as coronaviruses and other zoonotic viruses from wild animals inhabiting Russia (primarily bats and insectivores). Key research areas include developing protocols (using genomic and proteomic data) for the detection and characterization of biological threats to human health, and investigating patterns of global virus spread by mammals.
- ГдеСколковский Институт Науки и Технологий (Москва, Территория Инновационного Центра “Сколково”, Большой бульвар, д. 30, стр. 1)
- Когда25-26 октября 2025 года
Сроки подачи тезисов до 31.07.2025
Сроки регистрации на конференцию до 15.09.2025
- Как участвовать
- WhereSkolkovo Institute of Science and Technology (Moscow, Territory of the Skolkovo Innovation Center, Bolshoy Boulevard 30, building 1)
- WhenOctober 25-26, 2025
Deadline for submission of abstracts until 31.07.2025
Deadline for conference registration till 15.09.2025 - How to participate
Команда
Team
Team
- Артем Исаев
Artem Isaevк.б.н., CMCB Skoltech, заведующий лабораторией анализа метагеномов
Организатор конференции
PhD, Assistant Professor CMCB Skoltech, head of the Laboratory of Metagenome Analysis
Conference organiser - Ирина Балаж
Irina BalazsMD PhD, к.б.н., с.н.с. НИЦ "Курчатовский институт", с.н.с. ФГБУ ФНКЦ ФХМ им. Ю.М. Лопухина ФМБА России
Председатель оргкомитета
MD PhD, Senior PostDoc NRC "Kurchatov Institute", Senior PostDoc Lopukhin Federal Research and Clinical Center of Physical-Chemical Medicine of Federal Medical Biological Agency
Head of the organising committee - Мария Тутукина
Maria Tutukinaк.б.н., с.н.с. CMCB Skoltech, заведующий лабораторией в Институте общей генетики РАН
Участник оргкомитета
PhD, Senior PostDoc CMCB Skoltech, head of the Laboratory at Vavilov Institute of General Genetics Russian Academy of Sciences
Member of the organising committee - Алексей Куликовский
Alexey Kulikovskyк.б.н, CMCB Skoltech, зам. заведующего учебной биомедицицинской лабораторией
Участник оргкомитета
PhD, CMCB Skoltech, Deputy Head of Biomedical Teaching Laboratory
Member of the organising committee - Алексей Ливенский
Aleksei Livenskiiм.н.с. лаборатории молекулярной генетики ИБГ РАН, преподаватель ФББ МГУ, cтажер-исследователь лаборатории анализа метагеномов Сколтех
Участник оргкомитета
Junior Researcher Laboratory of Molecular Genetics Institute of Gene Biology Russian Academy of Sciences, lecturer Moscow State University, research intern Laboratory of Metagenome Analysis Skoltech
Member of the organising committee - Михаил Скутель
Mikhail SkutelАспирант, CMCB Skoltech, лаборатория анализа метагеномов
Участник оргкомитета
PhD student, CMCB Skoltech, Laboratory of Metagenome Analysis
Member of the organising committee - Оксана Котовская
Oksana KotovskayaАспирант, CMCB Skoltech, лаборатория анализа метагеномов
Участник оргкомитета
PhD student, CMCB Skoltech, Laboratory of Metagenome Analysis
Member of the organising committee - Ксения Зарипова
Ksenia Zaripovaк.б.н., CMCB Skoltech, специалист лаборатории анализа метагеномов
Участник оргкомитета
PhD, CMCB Skoltech, technician of the Laboratory of Metagenome Analysis
Member of the organising committee - Дарья Яновская
Daria YanovskayaАспирант, МФТИ, cтажер-исследователь лаборатория анализа метагеномов Сколтех
Участник оргкомитета
PhD student MIPT, research intern Laboratory of Metagenome Analysis Skoltech
Member of the organising committee - Светлана Вихрова
Svetlana VikhrovaЛаборант-исследователь, НИЦ «Курчатовский институт», студент специалитета Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова
Участник оргкомитета
Lab technician NRC "Kurchatov Institute", student of the Sechenov First Moscow State Medical University
Member of the organising committee - Матвей Колесник
Matvey Kolesnikк.б.н., научный сотрудник ИБГ РАН
Участник оргкомитета
PhD, PostDoc Institute of Gene Biology Russian Academy of Sciences
Member of the organising committee - Аксиния Гайдукова
Aksiniya GaydukovaНП «Биоинформатический семинар», Просветительский фонд «Эволюция»
Организатор конференции
NP "Bioinformatics seminar", Educational foundation "Evolution"
Conference organiser - Дмитрий Сутормин
Dmitry SutorminPhD, CMCB Skoltech, зам. заведующего лаборатории анализа метагеномов
Участник оргкомитета
PhD, CMCB Skoltech, Deputy Head of Laboratory of Metagenome Analysis
Member of the organising committee
Форма регистрации и подача тезисов
Registration and abstract submission
Регистрация закрыта! Спасибо всем зарегистрировавшимся
Партнеры / Partners
Контакты / Contacts
studymetarussia@gmail.com
Также подписывайтесь на нас в Telegram
Также подписывайтесь на нас в Telegram